R语言 spikeLI包 collapse()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

collapse(spikeLI)
collapse()所属R语言包：spikeLI

                                         Data collapse of all concentrations into a single graph
                                         所有的浓度成一个单一的图形数据崩溃

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function takes as input one or more (up to four) probe sets of the Latin square spike-in data and produces collapse plots. A collapse plot contains data of different concentrations into a single graph. The user can compare in how far the data follows the predicted Langmuir behavior which is also given in the plot. Two models are compared: the basic Langmuir Isotherm and the Langmuir Isotherm with hybridization in solution.
这个函数作为输入一个或多个（最多四个）拉丁方的探针集尖峰数据和生产崩溃图。崩溃的图包含了不同浓度的数据到一个单一的图形。用户可以比较数据如下多远的预测符合Langmuir行为，这也是在给定的图。比较两种模式：基本符合Langmuir等温线和Langmuir吸附等温与溶液中的杂交。


用法----------Usage----------


collapse(probe_set, param = "NULL", probes = "NULL", output = "NULL", filename = "NULL")



参数----------Arguments----------

参数：probe_set
This has to take the value of a probe set  
这采取的探针集的价值


参数：param
In input one or more probe sets can be given  
可以在输入一个或多个探针集


参数：probes
A vector containing the probes   
一个向量，包含探针


参数：output
"PS" output on a postscript file  
“ps”输出的PostScript文件


参数：filename
the file in which collapses are given  
在给定的文件倒塌


作者（S）----------Author(s)----------


   Delphine Baillon, Paul Leclercq, Sarah Ternisien, Thomas Heim and Enrico Carlon



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>Ivsc</code>, <code>IvsDG</code>, <code>hgu</code>, <code>SPIKE_IN</code>, <code>SPIKE_INA</code>, <code>SPIKE_INB</code>, <code>SPIKE_INH</code>

举例----------Examples----------


## You may display the matched intensities of a Probe-Set according to the Delta-G value[＃你可能会显示匹配的探针集强度，根据DeltaG值]
     collapse("1091_at")

## You may restrict the value to the Perfect match or mis-matches[＃你可以限制价值的完美匹配或不匹配]
     collapse("1091_at","PM")

## You may restrict the values risplayed for only a number of probes[＃你可以限制值只有探针risplayed]
     collapse("1091_at",probes=c(1,9))

## You may output the graphs to a postscript file[＃你可以到一个postscript文件输出图形]
     collapse("1091_at",output="PS",filename="outfile.ps")

## You may display up to 4 probe-sets in the same window[＃你可以在同一窗口显示多达4个探针集]
     collapse(c("1091_at","37777_at",SPIKE_INA[1:2]))

## You can also use the values of the probe-sets contained in one of the Vectors of Human, Bacteria, [＃您也可以使用探针集在人力，细菌向量之一的值，]
## or Artificial Probe-sets[＃或人工探针套]
     collapse(SPIKE_INH)

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