geneIndcol(GGtools)
geneIndcol()所属R语言包:GGtools
tools for working with transManager instances
工作transManager实例的工具
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
tools for working with transManager instances
工作transManager实例的工具
用法----------Usage----------
geneIndcol(tm, col)
geneNames(tm)
locusNames(tm)
nthScores(tm, n)
topGenes(tm)
topScores(tm)
参数----------Arguments----------
参数:tm
instance of transManager-class
实例transManager-class
参数:col
column selector
列选择
参数:n
column selector
列选择
Details
详情----------Details----------
transManager instances have two ff matrices of size L x K where L is the number of SNP and K is the number of best feature scores to be retained. One matrix holds the scores, the other holds the indices of the gene list identifying the genes yielding the associated scores. Rows of the scores matrix are sorted; the leftmost column of the scores matrix is the maximum score.
transManager实例有两个尺寸长x k,其中L是SNP的数量和K是要保留的最好的功能分数FF矩阵。一个矩阵持有的分数,其他拥有的基因识别的基因产生的相关分数的指标。得分矩阵的行进行排序;分数矩阵的最左边的一列是最高得分。
值----------Value----------
each function returns a vector
每个函数返回一个向量
举例----------Examples----------
##---- Should be DIRECTLY executable !! ----[#----应直接执行!! ----]
##-- ==> Define data, use random,[ - ==>定义数据,使用随机的,]
##-- or do help(data=index) for the standard data sets.[# - 或做帮助的标准数据集(数据索引)。]
## The function is currently defined as[#函数定义为]
function (tm, col)
tm@base$inds[, col]
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
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