R语言 GGtools包 externalize()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

externalize(GGtools)
externalize()所属R语言包：GGtools

                                         create R package with decomposable smlSet representation
                                         创建R包与可分解smlSet代表

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

create R package with decomposable smlSet representation
创建R包与可分解smlSet代表


用法----------Usage----------


externalize(smlSet,
  packname,
  author = "Replace Me <auth@a.b.com>",
  maintainer = "Replace Me <repl@a.b.com>")



参数----------Arguments----------

参数：smlSet
instance of smlSet-class  
实例smlSet-class


参数：packname
arbitrary string naming the package that will hold the externalized representation – this should not coincide with the name of any installed package, as such would be overwritten  
任意字符串命名的包将于外向代表 - 这不应该配合任何已安装的软件包的名称等，将被覆盖


参数：author
string that should be a valid Author: entry for  a DESCRIPTION file  
字符串应该是一个有效的作者：一个描述文件的条目


参数：maintainer
string that should be a valid Maintainer: entry for  a DESCRIPTION file  
字符串应该是一个有效的维护者：一个描述文件的条目


Details

详情----------Details----------

Each SnpMatrix-class instance in the smlEnv slot of smlSet is written to disk in a folder inst/parts of the source package generated by this function.  The ExpressionSet-class instance in the smlSet is isolated and saved as eset.rda  to the data folder of the source package generated by this function.  
每个SnpMatrix-classsmlEnv槽的实例smlSet被写入到磁盘文件夹中的INST /这个函数生成的源代码包的部分。 在ExpressionSet-class实例smlSet是孤立的，eset.rda这个函数生成的源代码包的数据文件夹中保存。

getSS will construct an smlSet-class instance with the expression data and selected chromosomes
getSS会smlSet-class实例构建与表达数据和选定的染色体


值----------Value----------

instance of smlSet-class
实例smlSet-class


注意----------Note----------

The purpose is to avoid loading very large objects as SNP panels grow into the millions.  With this approach  in-memory images can be chromosome-size, or smaller if desired, depending on the structure of smList(smlSet).
其目的是为了避免加载非常大的对象的SNP面板到数以百万计的增长。内存中的图像，这种方法可以是染色体的大小或更小的如果需要的话，取决于上smList(smlSet)结构。


作者（S）----------Author(s)----------



VJ Carey <stvjc@channing.harvard.edu>




参见----------See Also----------

getSS
getSS


举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
if (!exists("hmceuB36.2021")) hmceuB36.2021 <- getSS("GGtools", c("20", "21"))
owd = getwd()
setwd(tempdir())
externalize(hmceuB36.2021, "hmdemo")
system("tar zcvf hmdemo.tar.gz hmdemo")
install.packages("hmdemo.tar.gz", repos=NULL)
library(hmdemo)
getSS("hmdemo", "20")
setwd(owd)

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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