R语言 ddCt包 SDMFrame()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

SDMFrame(ddCt)
SDMFrame()所属R语言包：ddCt

                                        Read an SDM file
                                         读取SDM文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Read an SDM file: Data Output File for SDS, Version 2.1
读取SDM文件：数据输出文件的SDS，2.1版


用法----------Usage----------


  SDMFrame(file)
  readSDM(file)



参数----------Arguments----------

参数：file
Character vector of filenames
文件名的特征向量


Details

详情----------Details----------

This function reads the data given in the colums 'Detector','Sample' and 'Ct' of the specified SDM output file(s) and stores them as a data.frame. An additional column including the respective filename is added.
该函数读取的colums探测器，样品和CT指定的SDM输出文件（S）提供的数据和存储数据框。增加一个额外的列，其中包括相应的文件名。

This function is a wrapper for the SDMFrame constructor
这个函数是一个包装为SDMFrame构造


值----------Value----------

A object of class SDMFrame
一个对象的类SDMFrame


作者（S）----------Author(s)----------


Rudolf Biczok <a href="mailto:r.biczok@dkfz.de">mailto:r.biczok@dkfz.de</a>



举例----------Examples----------


## read a SDM file[＃读SDM文件]
sampdat <- SDMFrame(system.file("extdata", "Experiment1.txt",
                                package="ddCt"))
## you can also write [＃你也可以写]
## sampdat &lt;- new("SDMFrame",system.file("extdata", "Experiment1.txt",[＃sampdat < - 新（的“SDMFrame”。系统（“extdata”，“Experiment1.txt”]
##                                       package="ddCt"))[＃包=“DDCT”））]

## or with[＃或与]
## sampdat &lt;- readSDM(system.file("extdata", "Experiment1.txt",[＃sampdat < -  readSDM（。系统（“extdata”，“Experiment1.txt”]
##                                package="ddCt"))[＃包=“DDCT”））]

## use the getter methods[＃使用的getter方法]
sampleNames(sampdat)

## or the overloaded primitive accessors[＃或超载的原始存取]
sampdat[1:3,"Sample"]

## see all unique samples[＃看到所有独特的样品。]
uniqueSampleNames(sampdat)

## replace all sample names 'Sample1' and 'Sample2' in sampdat[＃替换所有样品名称的SAMPLE1“和”的sample2在sampdat的。]
## with 'NewSample1' and 'NewSample2'[＃NewSample1和NewSample2]
uniqueSampleNames(sampdat,c("Sample1","Sample2")) <- c("NewSample1","NewSample2")
uniqueSampleNames(sampdat)

## or use this syntax to replace the gene names[＃或使用此语法来取代基因名称]
uniqueDetectorNames(sampdat) <- c(Gene1="NewGene1", Gene2="NewGene2")
uniqueDetectorNames(sampdat)


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注：
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