r2cluster(ctc)
r2cluster()所属R语言包：ctc
Write to Cluster file format
写聚类文件格式
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Converting data to Cluster format
聚类格式的数据转换
用法----------Usage----------
r2cluster(data,labels=FALSE,colname="ACC",description=FALSE,
file="cluster.txt",dec='.')
参数----------Arguments----------
参数：file
the path of the file
该文件的路径
参数：data
a matrix (or data frame) which provides the data to put into the file
矩阵（或数据框）提供的数据放到文件
参数：labels
a logical value indicating whether we use the frist column as labels (ACC column in cluster file)
一个逻辑值，表明我们是否使用标签的第一列（聚类文件ACC列）
参数：colname
a character string indicating what kind of objects are in each row. YORF, MCLID, CLID, ACC can be used: see details.
一个字符串，指示什么样的对象是在每一行。 YORF，MCLID，发话号码，行政协调可以：查看详细信息。
参数：description
a logical value indicating whether we use the second column as description (NAME column for cluster file)
一个逻辑值，指示是否我们使用说明第二列（聚类文件名称列）
参数：dec
the character used in the file for decimal points
在文件中使用的字符，小数点
Details
详情----------Details----------
Software Cluster, made by M. Eisen needs formatted input data like:
软件产业聚类，研究艾森需要格式化的输入数据，如：
YORF http://genome-www.stanford.edu/cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+%22UNIQID%22
22UNIQID YORF http://genome-www.stanford.edu/cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+％22％
MCLID http://genome.rtc.riken.go.jp/cgi-bin/getseq?g+R+UNIQID
MCLID http://genome.rtc.riken.go.jp/cgi-bin/getseq?g+R+UNIQID
CLID http://genome-www4.stanford.edu/cgi-bin/SMD/source/sourceRes\-ult?op\-tion=CloneID&criteria1=IMAGE:UNIQID&choice=cDNA
发话号码
ACC http://genome-www4.stanford.edu/cgi-bin/SMD/source/sourceRes\-ult?op\-tion=Number&criteria=UNIQID&choice=cDNA
行政协调会
Line begining with EWEIGHT gives weights for each column (variable). Column GWEIGHT gives weights for each line (individuals).
行begining与EWEIGHT给每个列（变量）的重量。列GWEIGHT给每一行（个人）的重量。
注意----------Note----------
Cluster is a program made by M. Eisen that performs hierarchical clustering, K-means and SOM.
聚类是由M.艾森提出了方案，进行分层聚类，K-手段和SOM。
Cluster is copyrighted. To get or have information about Cluster: http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm
版权聚类。若要取得或有关聚类的信息：http://rana.lbl.gov/EisenSoftware.htm
作者（S）----------Author(s)----------
Antoine Lucas, <a href="http://antoinelucas.free.fr/ctc">http://antoinelucas.free.fr/ctc</a>
参考文献----------References----------
for Huge Clustering, R News, 2006, vol 6, issue 5 pages 58-60.
参见----------See Also----------
xcluster, r2xcluster, hclust
xcluster，r2xcluster，hclust
举例----------Examples----------
# Create data[创建数据]
set.seed(1)
m <- matrix(rep(1,3*24),ncol=3)
m[9:16,3] <- 3 ; m[17:24,] <- 3 #create 3 groups[创建3组]
m <- m+rnorm(24*3,0,0.5) #add noise[添加噪声]
m <- floor(10*m)/10 #just one digits[只是一个数字]
r2cluster(m)
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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发表于 2012-2-25 16:07:09
