R语言 cqn包 montgomery.subset()函数中文帮助文档(中英文对照)

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montgomery.subset(cqn)
montgomery.subset()所属R语言包：cqn

                                         Mongtomery RNA-seq data.
                                         mongtomery RNA-seq的数据。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A gene by sample count matrix for 10 samples from from Montgomery et al. Also included is information about these genes (length and gc content) as well as sequencing depth for each of the samples.
一个10蒙哥马利等人从样本的基因样本数矩阵。还包括有关这些基因（长度和GC含量），以及为每个样品的测序深度。


用法----------Usage----------


data(montgomery.subset)
data(sizeFactors.subset)
data(uCovar)



格式----------Format----------

montgomery.subset is a data frame with 23552 observations on 10 different samples, the column names are the sample ids. sizeFactors.subset a a named vector of length 10 containing the number of mapped reads for each of the 10 samples.  uCovar is a data frame with 23552 observations on 2 different covariates: gc content and genic length in bp.
montgomery.subset是一个有23552对10个不同的样本观测数据框，列名的样品ID。 sizeFactors.subsetAA命名的长度为10的向量包含映射的数量每10个样品的读取。 uCovar是一个有23552对2个不同的协变量的观测数据框：GC含量和基因长度在BP。


Details

详情----------Details----------

Gene models are union models based on Ensembl 61.  These gene models were constructed using Genominator.  Genes that have zero counts in all 10 samples were excluded.  
基因模型是基于Ensembl的61工会模式。这些基因模型构建使用Genominator。在所有10个样品的计数为零的基因被排除在外。


参考文献----------References----------

Nisbett, R Guigo, ET Dermitzakis, (2010)  “Transcriptome genetics using second generation sequencing in a Caucasian population”. Nature 464(7289), 773-777.
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