makeShapeCon(cosmo)
makeShapeCon()所属R语言包:cosmo
Constructing a shape constraint
构建一个形状约束
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function constructs a shapeCon object representing a constraint on the unknown position weight matrix that requires the information content to follow a particular functional form.
这个函数构造一个shapeCon对象代表一个未知的位置权重矩阵需要的信息内容按照特定功能的形式约束。
用法----------Usage----------
makeShapeCon(shape, sLower, sUpper, eLower, eUpper, error)
参数----------Arguments----------
参数:shape
character the functional form of the information content. This must be either Linear, MonotoneIncreasing, or MonotoneDecreasing.
character信息内容的功能形式。这必须是Linear,MonotoneIncreasing或MonotoneDecreasing。
参数:sLower
numeric lower bound on the information content at the start of the interval
numeric下界的信息内容,在间隔的开始
参数:sUpper
numeric upper bound on the information content at the start of the interval
numeric间隔开始在信息内容上的约束
参数:eLower
numeric lower bound on the information content at the end of the interval
numeric下界的信息内容,在间隔结束
参数:eUpper
numeric upper bound on the information content at the end of the interval
numeric上的信息内容必将在间隔结束
参数:error
numeric tolerance for how much the actual information content profile is allowed to deviate from the prescribed form
numeric容忍多少实际信息内容的文件被允许偏离规定的形式
值----------Value----------
An object of class shapeCon.
对象类shapeCon。
作者(S)----------Author(s)----------
Fabian Gallusser, <a href="mailto:fgallusser@berkeley.edu">fgallusser@berkeley.edu</a>
参见----------See Also----------
boundCon, subMotifCon, posFreqCon, shapeCon, shapeDiffCon, palCon
boundCon,subMotifCon,posFreqCon,shapeCon,shapeDiffCon,palCon
举例----------Examples----------
sc <- makeShapeCon("Linear",1.0, 2.0, 1.5, 2.0, 0.05)
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