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R语言 coRNAi包 InteractLevelPlot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:51:43 | 显示全部楼层 |阅读模式
InteractLevelPlot(coRNAi)
InteractLevelPlot()所属R语言包:coRNAi

                                         function to visualize interactions as a levelplot
                                         功能,可视化的交互1 levelplot

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

visualizes significant interactions as a levelplot
可视化1 levelplot显着交互作用


用法----------Usage----------


InteractLevelPlot(toptable, thresh = 0.001, by = "P.Value", key = FALSE, col.regions = colorRampPalette(c("blue", "white", "yellow")),zerolimit=0)



参数----------Arguments----------

参数:toptable
toptable table from function topTable  
toptable表从功能topTable


参数:thresh
thresh numeric, threshold for significance  
thresh数字,阈值的意义


参数:by
by column in topTable that thresh should be applied to  
by列,阈值应适用于在topTable


参数:key
key optional, data frame with groupings of the genes in the toptable   
key可选,数据框的基因组中的toptable


参数:col.regions
col.regions colors to be used  
col.regions要使用的颜色


参数:zerolimit
zerolimit threshold below which interactions should be colored as 0.  
zerolimit阈值,低于该相互作用应着色为0。


值----------Value----------

a levelplot, pdf files with graphs
1 levelplot,图的PDF文件


作者(S)----------Author(s)----------



Elin Axelsson




参见----------See Also----------

levelplot
levelplot


举例----------Examples----------


# similated data[similated数据]
data(screen1_raw)
df = cellHTS2df(screen1_raw,neutral="Fluc")
tt = data.frame("ID"=(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),"size"=runif(length(unique(df$Pair[df$Type=="comb"])),-2,2),stringsAsFactors=FALSE)
InteractLevelPlot(tt,thres=0,by="size")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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