R语言 coRNAi包 InteractGraph()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

InteractGraph(coRNAi)
InteractGraph()所属R语言包：coRNAi

                                         functions to visualize interactions as a graph
                                         可视化图形交互的功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

visualizes significant interactions as a graph
可视化图形显着交互作用


用法----------Usage----------



InteractGraph(toptable,thresh,sizecutoff=0,by,key=FALSE,file="interactions",colors = list(neg="blue",pos="yellow",key="brown",node="grey"))



参数----------Arguments----------

参数：toptable
toptable table from function topTable  
toptable表从功能topTable


参数：thresh
thresh numeric, threshold for significance  
thresh数字，阈值的意义


参数：sizecutoff
sizecutoff a minimal absolute size of a interaction for it to be included in the graph as an edge.  
sizecutoff最小的一个互动的绝对大小，它被包含在图作为边缘。


参数：by
by column in topTable that thresh should be applied to  
by列，阈值应适用于在topTable


参数：key
key optional, data frame with groupings of the genes in the toptable   
key可选，数据框的基因组中的toptable


参数：file
file name of the file the results will be outputed to.  
file文件名结果将outputed，到。


参数：colors
colors list with colors to be used for pos interactions, neg interactions, key (nodes in key) and normal nodes.      
colors POS互动使用的颜色，NEG的相互作用，关键的关键节点和正常节点列表。


值----------Value----------

pdf file with graph
用图形的PDF文件


作者（S）----------Author(s)----------



Elin Axelsson




参见----------See Also----------

levelplot
levelplot


举例----------Examples----------




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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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