R语言 copa包 summaryCopa()函数中文帮助文档(中英文对照)

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summaryCopa(copa)
summaryCopa()所属R语言包：copa

                                         Create Summary Showing Top Gene Pairs
                                         显示热门基因对创建综述

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function can be used to output a data.frame containing the ID and optionally the gene symbol for the top gene pairs, based on the number of outliers.
此功能可以用来输出数据框包含的顶级基因对ID和可选的基因符号，离群的数量的基础上。


用法----------Usage----------


summaryCopa(copa, pairnum, lib = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：copa
An object of class 'copa', resulting from a call to the copa function.  
一个对象类杯，copa函数的调用。


参数：pairnum
The maximum number of outlier pairs to be output. A table can be output first using tableCopa
离群值对最大数量是输出。一个表可以输出首先使用tableCopa


参数：lib
For Affymetrix data that have an annotation package, this can be specified and the table will then also contain the gene symbol
Affymetrix数据，有一个注解包，可以指定表，然后将还包含了基因符号


值----------Value----------

The output from this function is a data.frame with the number of outliers, the manufacturer identifiers, and optionally, the gene symbol for the genes.
从这个函数的输出是一个data.frame与离群，制造商标识，并有选择地，为基因的基因符号。


作者（S）----------Author(s)----------


James W. MacDonald <jmacdon@med.umich.edu>



参考文献----------References----------

factor genes in prostate cancer.

举例----------Examples----------


if(interactive()){
library(Biobase)
data(sample.ExpressionSet)
cl <- abs(3 - as.numeric(pData(sample.ExpressionSet)[,2]))
tmp <- copa(sample.ExpressionSet, cl)
summaryCopa(tmp, 6)
}

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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