twowayTable(CoCiteStats)
twowayTable()所属R语言包：CoCiteStats
Compute a two way co-citation table for 2 genes.
计算出的2个基因的双向合作，引用表。
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function computes a two way table for comparing co-citation, in PubMed for the two input genes. The values in the table can be adjusted according to either the paper size or the gene size.
此函数计算两个输入基因比较期刊共引，双向表。根据纸张大小或基因的大小，可以调整表中的值。
用法----------Usage----------
twowayTable(g1, g2, weights = TRUE, paperLens=paperLen())
参数----------Arguments----------
参数：g1
The EntrezGene identifier for gene 1.
1基因的EntrezGene标识符。
参数：g2
The EntrezGene identifier for gene 2.
2基因EntrezGene标识符。
参数：weights
TRUE or FALSE indicating whether paper size weights should be used.
TRUE或FALSE指示是否应使用纸张尺寸重量。
参数：paperLens
A vector containing the number of genes each paper refers to, or cites.
每个文件是指一个向量，包含的基因数量，或引用。
Details
详情----------Details----------
To determine the association between two genes one can use co-citation in the medical literature. When weights is FALSE this function computes the number of papers that cite only gene 1, only gene 2, both and neither.
要确定这两个基因之间的关联，可以使用在医学文献共引。当weights是FALSE这个函数计算只有1基因，只有2基因，双方既不论文引用的数量。
By default, we use the org.Hs.eg.db package to define the set of papers that are used in the computations. For other organisms, or for more restricted sets of papers the user will need to supply the vector paperLens explicitly.
默认情况下，我们使用org.Hs.eg.db包定义在计算中使用的一组文件。对于其他生物，或更受限制的文件集的用户将需要提供矢量paperLens明确。
One can consider papers which cite many genes to be less informative than those that cite only a few genes. If weights is TRUE (the default) then papers are weighted by the inverse of the number of citations.
一个可以考虑举出许多基因的论文是比那些只举出几个基因信息。如果weights是TRUE（默认），论文被引用次数的倒数加权。
值----------Value----------
A vector of length four, with entries n11, n12, n21 and n22. These correspond to the number of papers that cite both genes, the number that cite only gene 1, the number that cite only gene 2, and the total number of papers minus those counted in n11, n21, n12, or in the default case the weighted versions of these quantities.
向量的长度为4项，n11，n12，n21和n22。这些对应举这两个基因的论文，举基因1，举唯一的基因2，论文总数减去算那些在n11，n21 n12，或在默认情况下，这些数量的加权版本。
作者（S）----------Author(s)----------
R. Gentleman
参见----------See Also----------
paperLen, twTStats
paperLen，twTStats
举例----------Examples----------
pL = paperLen()
twowayTable("10", "100", paperLens=pL)
twowayTable("10", "100", FALSE, paperLens=pL)
转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。
注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。
|
发表于 2012-2-25 15:43:13
