gene.geneslist.sig(CoCiteStats)
gene.geneslist.sig()所属R语言包:CoCiteStats
Compute 3 two-way table statistics and p-values,
计算3双向表的统计信息和p值,
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function calculates Concordance, Jaccard's index and Hubert's Γ with no adjustment, adjusting for paper size (PS), adjusting for gene size (GS) and both, to evaluate the significance of co-citation of a gene of interest and a gene list
此函数计算一致性,Jaccard指数和休伯特的Γ不作调整,调整纸张大小(PS),基因大小(GS)和两个调整,以评估一个感兴趣的基因共引的意义,基因列表
用法----------Usage----------
gene.geneslist.sig(gene, geneslist, paperLens = paperLen(), n.resamp=100)
参数----------Arguments----------
参数:gene
The Entrez Gene ID for the gene of interest.
Entrez基因身份证感兴趣的基因。
参数:geneslist
The list of Entrez Gene IDs for genes with which the co-citation of the gene of interest is to be evaluated.
Entrez基因标识基因列表感兴趣的基因共引进行评估。
参数:paperLens
The sizes of the PubMed papers for consideration.
审议的期刊论文的大小。
参数:n.resamp
Number of resampling for generating empirical p-values.
重采样产生经验的P-值的数量。
值----------Value----------
Statistics and resampling p-values for all 3 two-way tables along with the 4 adjustments for gene and geneslist based on n.resamp resamplings.
所有3个双向4gene和geneslistn.resampresamplings的调整表的统计和重采样p值。
作者(S)----------Author(s)----------
Beiying Ding
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
actorAdjTable, paperLen,
actorAdjTable,paperLen
举例----------Examples----------
gene <- "705"
geneslist <- "7216"
gene.geneslist.sig(gene, geneslist, n.resamp=50)
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