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R语言 CNTools包 CNSeg-class()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 15:38:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
CNSeg-class(CNTools)
CNSeg-class()所属R语言包:CNTools

                                        Class "CNSeg" contains the output of DNACopy segmentation data
                                         类“CNSeg”包含的输出DNACopy分割数据

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Segmentation results of copy number data can not be  operated by other analysis tools such as classification. The  class "CNSeg" provides methods to convert segmentation data into a (what is called Reduced segments (RS))matrix format
拷贝数数据的分割结果不能由其他分析工具,如分类经营。类“CNSeg”(什么叫做减少的分部(RS))矩阵格式转换成分割的数据提供了一些方法


类的对象----------Objects from the Class----------

Objects can be created by calls of the form new("CNSeg",..). A constructor CNSeg(segList) can also be used to instantiate  CNSeg object
创建对象可以通过检测的形式new("CNSeg",..)。构造CNSeg(segList)也可用于实例化CNSeg对象


插槽----------Slots----------




segList: Object of class "data.frame" is the "output" element of the object return by the segment
segList:"data.frame"类对象是对象返回的元素的“输出”段




chromosome: Object of class "character" is
chromosome:"character"类的对象




end: Object of class "character" is
end:"character"类的对象




start: Object of class "character" is
start:"character"类的对象




segMean: Object of class "character" is
segMean:"character"类的对象




id: Object of class "character" is
id:"character"类的对象


方法----------Methods----------




getRS signature(object = "CNSeg"): get the
getRSsignature(object = "CNSeg"):得到




segList signature(object = "CNSeg"): get the
segListsignature(object = "CNSeg")得到




segList<- signature(object = "CNSeg"): set the
segList < - signature(object = "CNSeg"):设置




show signature(object = "CNSeg"): print a CNSeg
显示signature(object = "CNSeg"):打印CNSeg


作者(S)----------Author(s)----------


Jianhua Zhang



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>RS</code>

举例----------Examples----------


   data("sampleData")
   # take a subset of the data for speed[利用速度数据的一个子集]
   seg <- CNSeg(sampleData[which(is.element(sampleData[, "ID"],
       sample(unique(sampleData[, "ID"]), 10))), ])
   rsBypair <- getRS(seg, by = "pair", imput = FALSE, XY = FALSE, what = "mean")
   rsBypair

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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