R语言 cn.farms包 normalizeCels()函数中文帮助文档(中英文对照)

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normalizeCels(cn.farms)
normalizeCels()所属R语言包：cn.farms

                                        Wrapper for the normalization functions
                                         包装的标准化功能

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This functions provides different normalization methods for microarray data. At the moment only SOR and quantile normalization are implemented.
此功能提供了不同的微阵列数据标准化方法。目前，只有SOR与分量标准化的贯彻落实。


用法----------Usage----------


  normalizeCels(filenames,
    method = c("SOR", "quantiles", "none"), cores = 1,
    alleles = FALSE, runtype = "bm", annotDir = NULL,
    saveFile = "normData", ...)



参数----------Arguments----------

参数：filenames
The absolute path of the CEL files as a list.
列表CEL文件的绝对路径。


参数：method
The normalization method. Possible methods so far: SOR, quantiles
归一化法。可能的方法，到目前为止长远，位数


参数：cores
Number of cores for used for parallelization.
为并行使用的核心数量。


参数：alleles
States if information for allele A and B should be given back.
如果A和B等位基因的信息应还给国家。


参数：runtype
Mode how the results are saved. Possible values are ff or bm. If ff is chosen the data will not be saved automatically. With bm the results will be saved permanently.
模式的结果如何保存。可能的值是FF或BM。如果选择FF是数据将不会被自动保存。与BM的结果将永久保存。


参数：annotDir
An optional annotation directory.
可选批注目录。


参数：saveFile
Name of the file to save.
保存的文件名称。


参数：...
Further parameters for the normalization method.
为进一步标准化的方法参数。


值----------Value----------

An ExpressionSet object with the normalized data.
一个规范化的数据ExpressionSet对象。


作者（S）----------Author(s)----------



Djork-Arne Clevert <a href="mailtokko@clevert.de">okko@clevert.de</a> and Andreas
Mitterecker <a href="mailto:mitterecker@bioinf.jku.at">mitterecker@bioinf.jku.at</a>




举例----------Examples----------


## Not run: [＃无法运行：]
library("hapmapsnp6")
celDir <- system.file("celFiles", package = "hapmapsnp6")
filenames <- dir(path = celDir, full.names = TRUE)
createAnnotation(filenames = filenames)
normData <- normalizeCels(filenames, method = "SOR")

## End(Not run)[＃结束（不运行）]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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