toplist(CMA)
toplist()所属R语言包:CMA
Display 'top' variables
显示“顶”变量
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This is a convenient method to get quick access to the most important variables, based
这是一个方便的方法来快速访问最重要的变量,根据
用法----------Usage----------
toplist(object, k = 10, iter = 1, show = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:object
An object of genesel.
genesel的对象。
参数:k
Number of top genes for which information should be displayed. Defaults to 10.
应信息顶端基因的数量显示。默认为10。
参数:iter
teration number (learningset) for which tuning results should be displayed.
蚀变(learningset)应显示调整结果。
参数:show
Should the results be printed ? Default is TRUE.
应印制的结果吗?默认TRUE。
参数:...
Currently unused argument.
目前未使用的参数。
值----------Value----------
The type of output depends on the gene selection scheme. For the multiclass case, if gene selection has been run with the "pairwise" or "one-vs-all" scheme, then the output will be a list of data.frames, each containing the gene indices plus variable importance for the top k genes. The list elements are named according to the binary scenarios (e.g., 1 vs. 3). Otherwise, a single data.frame is returned.
输出的类型取决于基因的选择方案。为多的情况下,如果基因选择"pairwise"或"one-vs-all"计划,那么输出将是一个列表data.frames,每个包含的基因指数加变量的重要性,对于已运行顶k基因。列表中的元素被命名为根据二进制场景(例如,1 vs. 3)。否则,单data.frame返回。
作者(S)----------Author(s)----------
Martin Slawski <a href="mailto:ms@cs.uni-sb.de">ms@cs.uni-sb.de</a>
Anne-Laure Boulesteix <a href="mailto:boulesteix@ibe.med.uni-muenchen.de">boulesteix@ibe.med.uni-muenchen.de</a>
参考文献----------References----------
CMA - A comprehensive Bioconductor package for supervised classification with high dimensional data. BMC Bioinformatics 9: 439
参见----------See Also----------
genesel, GeneSelection, plot,genesel-method
genesel,GeneSelection,plot,genesel-method
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