barplot画直方图，有的自动生成横坐标，有的却没有，为什么

xieguoyun1990

数据都是通过同一程序跑出来的，格式完全一样，barplot()函数画直方图:

1. allbasebias<-read.delim2(1.txt,sep="\t",header=T)#2.txt
   

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问题1：
一个文件读进去后，为什么自动把第一行作为行名，另一个却没有？
   sRNA.position A  C  G  T
1              3 4 NA NA NA
2              1 6 NA NA NA
3              2 2  1  2 NA
4              1 2  4 NA NA
5              2 3  2 NA NA


   sRNA.position A  C  G  T
1              1 1  4  2 NA
2              2 1  5  1 NA
3              3 3  4 NA NA
4              4 5  1  1 NA
5              5 4  1  2 NA

1. data<-t(as.matrix(allbasebias))
   
2. barplot(data,width=1,col=rainbow(4),space=0.5,bty="n",xpd=TRUE)
   
3. a<-names(allbasebias)
   
4. legend(26.8,6,legend=a[2:5],cex=0.5,lty=1,col=rainbow(4))
   
5. abline(h=0)
   

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画直方图时，有些自动生成横坐标，有些却没有？


初学之人，请高人帮忙指教
两个数据如附件

genechip

第一个问题 主要是你 txt文档有问题。
你用txt打开后 所有数据都在一行，而用excel打开就是一个矩阵形式。所以你需要将txt文档中内容重新保存成矩阵形式。
如果解决这个问题，就不存在你说的第一个问题

genechip

第二个问题 是因为 你的数据data 没有列名字。如果有就会自动显示横坐标，如果没有就不显示。

data<-t(as.matrix(allbasebias))
colnames(data)<-1:20
barplot(data,width=1,col=rainbow(4),space=0.5,bty="n",xpd=TRUE)

a<-names(allbasebias)

legend(26.8,6,legend=a[2:5],cex=0.5,lty=1,col=rainbow(4))

abline(h=0)

xieguoyun1990

genechip 发表于 2013-8-3 20:37
第一个问题 主要是你 txt文档有问题。
你用txt打开后 所有数据都在一行，而用excel打开就是一个矩阵形式。 ...

恩恩，后来我也意识到这个问题了，谢谢