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GOTM:Gene Ontology Tree Machine 介绍

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发表于 2013-2-22 20:51:23 | 显示全部楼层 |阅读模式
GOTM:Gene Ontology Tree Machine [http://bioinfo.vanderbilt.edu/gotm/]
GOTM是一个基于web的工具,基于GO等级结构分析和显示感兴趣的基因集。这个工具提供了用户友好的数据导航和可视化。产生可扩展的树用于浏览GO等级结构,以 HTML的形式生成固定的树用于对不同注释水平进行归档并生成柱状图,GOTM提供统计分析以显示GO类别和相对富集的基因数目以及暗示 (suggest)了进一步研究的生物领域。富集的GO类别能够以子树或DAGs的形式展示。基因的子集能够检索GO术语或进行关键字搜索。每一个基因的细节信息能够直接从GeneKeyDB里检索到。


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