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GOdist介绍

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发表于 2013-2-22 20:39:16 | 显示全部楼层 |阅读模式
GOdist [http://basalganglia.huji.ac.il/links.htm]
GOdist是一个Matlab程序,用于分析Affymetrix芯片表达数据,实现了Kolmogorov-Smirnov(KS)连续统计方法。还引入一个两侧超几何分布(two-tailed hypergeometric distribution)使用Fisher exact检验实现了离散方法。GOdist能够检测出芯片基因相关的GO术语相对于不同总体的差别,总体可是是全局芯片总体、分析的GO术语的直接父节点或全局父节点。

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