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eGOn v2.0:explore Gene Ontology 介绍

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发表于 2013-2-22 20:26:25 | 显示全部楼层 |阅读模式
eGOn v2.0:explore Gene Ontology [http://www.genetools.no/]
基于web的工具,映射表达谱数据到GO结构上。多个的输入文件能够同时分析以比较两个或多个实验的注释基因的分布。
eGOn V2.0的核心特性:
.可视化:基因注释以GO DAG可视化显示或以表格的形式显示,GO DAG的尺寸能够由用户自由定义。
.过滤:GO注释能够基于evidence codes进行过滤。
.包含用户定义的GO注释:事先加入到NMC注释数据库中。
.统计分析:多个基因列表能够同时分析以比较GO等级上注释基因的分布,统计测验设计成允许用户在两个基因列表之内或之间计算GO注释的不同(dissimilarities)。
.连接注释数据库:连接到NMC注释数据库,基因和蛋白的信息直接由GO DAG或导出的数据提供。
.导出:GO DAG信息、统计结果、基因和蛋白信息能够导出为Excel、text、XML格式。

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