sampleClusterdData(clippda)
sampleClusterdData()所属R语言包:clippda
A function to arrange the data in sample-wise pairs
安排明智的样品,对数据的函数
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function arranges the duplicate data, grouped by samples, in a form which can be averaged using the limma function
此功能安排的重复数据,可以平均使用limma函数的形式,由样本分组,
用法----------Usage----------
sampleClusteredData(Data, no.peaks)
参数----------Arguments----------
参数:Data
A data frame of duplicate data from the biomarker wizard.
数据框的重复数据,从生物标志物的向导。
参数:no.peaks
The number of peaks detected by the biomarker wizard.
峰检测的生物标志物的向导。
Details
详情----------Details----------
The output is a dataframe of repeated sample expression values, clustered by samples. This data is used as an input to the betweensampleVariance function, and is then averaged and used to compute the biological variance as well as the mean difference in the expression values between cancer and noncancer controls.
输出的是一个重复的样本表达式的值dataframe,由样本聚类。这个数据被用来作为一个betweensampleVariance函数的输入,然后平均和用于计算的生物变异,以及在与癌症和非癌症控制表达式的值的平均差异。
值----------Value----------
The output is a dataframe of repeated sample expression values, clustered by samples.
输出的是一个重复的样本表达式的值dataframe,由样本聚类。
作者(S)----------Author(s)----------
Stephen Nyangoma
举例----------Examples----------
# arrange the data in a form which can be averaged by the limma function dupcor[安排在表单中的数据可以通过的limma功能dupcor平均]
# use the function called limmaData[使用称为limmaData功能]
data(liverdata)
no.peaks <- 53
Data <- liverdata
JUNK_DATA <- sampleClusteredData(Data,no.peaks)
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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