R语言 clippda包 proteomicsExprsData()函数中文帮助文档(中英文对照)

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proteomicsExprsData(clippda)
proteomicsExprsData()所属R语言包：clippda

                                         A generic fuction to extract duplicate SELDI data from an  object of aclinicalProteomicsData class  in the same format as the data from Biomarkers wizard
                                         一个通用的提取aclinicalProteomicsData类的一个对象，在相同的格式的数据，从生物标志物的向导重复SELDI技术数据的作用探讨

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This generic function extracts a matrix of duplicate SELDI data from an  object of aclinicalProteomicsData class. It then converts it into a dataframe  which is in the same format as the data from Biomarkers wizard. In this dataframe, the intensities and the subject  mass-to-charge ratio are represented as numeric variables, while the sample-tag is represented as a character variable.  
这个泛型函数提取从aclinicalProteomicsData类的对象重复SELDI技术数据矩阵。然后将其转换成dataframe这是作为生物标志物向导的数据格式相同。强度和受质荷比在此dataframe，代表作为数字变量，而样品标签代表一个字符变量。


用法----------Usage----------


proteomicsExprsData(Data, ...)



参数----------Arguments----------

参数：Data
is an object of a aclinicalProteomicsData class.  
是aclinicalProteomicsData类的对象。


参数：...
means other defined arguments. Currently, we have not defined additional arguments.   
指其他定义的参数。目前，我们还没有定义额外的参数。


值----------Value----------

A dataframe of expression values, the substance mass, patient labels, and  any other defined sample information.
一个表达式的值dataframe，物质的质量，病人的标签，以及任何其他定义的样本资料。


作者（S）----------Author(s)----------



S Nyangoma




举例----------Examples----------


data(liverdata)

data(liver_pheno)

OBJECT=new("aclinicalProteomicsData")

OBJECT@rawSELDIdata=as.matrix(liverdata)
OBJECT@covariates=c("tumor" ,    "sex")
OBJECT@phenotypicData=as.matrix(liver_pheno)
OBJECT@variableClass=c('numeric','factor','factor')
OBJECT@no.peaks=53

head(proteomicsExprsData(OBJECT))

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