gam.functions(xpose4specific)
gam.functions()所属R语言包:xpose4specific
GAM functions for Xpose 4
的GAM功能为XPOSE 4
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
These are functions for running the generalized additive model within Xpose 4, summarizing its results, and plotting them.
这是广义相加模型4内XPOSE,总结其结果,并绘制它们的功能。
用法----------Usage----------
xp.gam(object,
parnam=xvardef("parms", object),
covnams = xvardef("covariates", object),
wts.col=NULL,
ask.for.input=TRUE,
overwrite=TRUE,
...)
check.gamobj()
xp.akaike.plot(title = NULL,
xlb = "Akaike value",
ylb = "Models",
gamobj=NULL,
...)
xp.check.scope(object,
covnam = xvardef("covariates", object),
nmods = object@Prefs@Gam.prefs$nmods,
smoother1 = object@Prefs@Gam.prefs$smoother1,
smoother2 = object@Prefs@Gam.prefs$smoother2,
smoother3 = object@Prefs@Gam.prefs$smoother3,
smoother4 = object@Prefs@Gam.prefs$smoother4,
arg1 = object@Prefs@Gam.prefs$arg1,
arg2 = object@Prefs@Gam.prefs$arg2,
arg3 = object@Prefs@Gam.prefs$arg3,
arg4 = object@Prefs@Gam.prefs$arg4,
excl1 = object@Prefs@Gam.prefs$excl1,
excl2 = object@Prefs@Gam.prefs$excl2,
excl3 = object@Prefs@Gam.prefs$excl3,
excl4 = object@Prefs@Gam.prefs$excl4,
extra = object@Prefs@Gam.prefs$extra,
...)
xp.cook(gam.object)
xp.ind.inf.fit(plot.ids = TRUE,
idscex = 0.7,
ptscex = 0.7,
title = NULL,
recur = FALSE,
xlb = NULL,
ylb = NULL,
gamobj=NULL,
...)
xp.ind.inf.terms(xlb = NULL,
ylb = NULL,
plot.ids = TRUE,
idscex = 0.7,
ptscex = 0.7,
prompt = TRUE,
gamobj=NULL,
...)
xp.ind.stud.res(title = NULL,
recur = FALSE,
xlb = NULL,
ylb = NULL,
gamobj=NULL)
xp.plot(plot.ids = TRUE,
idscex = 0.7,
ptscex = 0.7,
prompt = TRUE,
gamobj=NULL,
...)
xp.summary(gamobj=NULL)
参数----------Arguments----------
参数:object
An xpose.data object.
对象的xpose.data。
参数:title
A text string indicating plot title. If NULL, left blank.
显示图形标题的文本字符串。如果NULL,留为空白。
参数:xlb
A text string indicating x-axis legend. If NULL, left blank.
一个文本字符串,表示x轴的传说。如果NULL,留为空白。
参数:ylb
A text string indicating y-axis legend. If NULL, left blank.
一个文本字符串,表示y轴的传说。如果NULL,留为空白。
参数:covnam
A list of covariate variables to use in the GAM search.
列表的协变量使用GAM搜索。
参数:wts.col
Column in the object@Data.firstonly to use as weights on the parnam values.
列在object@Data.firstonly使用重量的parnam值。
参数:nmods
The number of modelfits to use when setting GAM scope. The default is 3.
的数量modelfits使用设置GAM范围时,。默认值是3。
参数:smoother1
Smoother for each model.
对于每一个模型更顺畅。
参数:smoother2
Smoother for each model.
对于每一个模型更顺畅。
参数:smoother3
Smoother for each model.
对于每一个模型更顺畅。
参数:smoother4
Smoother for each model.
对于每一个模型更顺畅。
参数:arg1
Argument for model 1.
模型的参数为1。
参数:arg2
Argument for model 2.
模型的参数为2。
参数:arg3
Argument for model 3.
模型的参数为3。
参数:arg4
Argument for model 4.
模型的参数为4。
参数:excl1
Covariate exclusion from model 1.
协变量排除在模型1。
参数:excl2
Covariate exclusion from model 2.
协变量排除在模型2。
参数:excl3
Covariate exclusion from model 3.
协变量排除在模型3。
参数:excl4
Covariate exclusion from model 4.
协变量排除在模型4。
参数:extra
Scope parameter for the GAM.
为GAM的范围参数。
参数:gam.object
A GAM object (see gam.
一个GAM对象(见gam。
参数:plot.ids
Logical, specifies whether or not ID numbers should be displayed.
逻辑,指定是否应显示ID号。
参数:idscex
ID label size.
ID标签的大小。
参数:ptscex
Point size.
点的大小。
参数:recur
If dispersion should be used in the GAM object.
如果分散体应在GAM对象使用。
参数:prompt
Specifies whether or not the user should be prompted to press RETURN between plot pages. Default is TRUE.
指定是否应提示用户按RETURN图页面之间。默认值是TRUE。
参数:parnam
The parameter to run the GAM on.
参数来运行的GAM。
参数:covnams
The covariates to test on the parnam
协变量上进行测试的parnam
参数:ask.for.input
Should the program ask for input from the user? Can be TRUE or FALSE.
如果程序要求用户输入的吗?可以为TRUE或FALSE。
参数:overwrite
Should we overwrite the gam object stored in memory if it exists already. Can be TRUE or FALSE.
如果我们覆盖了GAM存储在内存中的对象,如果它已经存在。可以为TRUE或FALSE。
参数:gamobj
A GAM object to use in the plot. IF null then the user is asked to choose from a list of GAM objects in memory.
一个GAM对象使用的图。如果为NULL,然后用户被要求选择从GAM内存中的对象的列表。
参数:...
Other arguments passed to the GAM functions.
其他参数传递的GAM功能。
Details
详细信息----------Details----------
Forthcoming.
即将出版。
值----------Value----------
A GAM fit.
不一定合适。
(作者)----------Author(s)----------
Niclas Jonsson & Andrew Hooker
参见----------See Also----------
gam, dotplot
gam,dotplot
实例----------Examples----------
## Not run: [#不运行:]
## We expect to find the required NONMEM run and table files for run[#我们希望找到所需的NONMEM运行和表文件运行的]
## 5 in the current working directory[排名第5的当前工作目录]
xpdb <- xpose.data(5)
## Run a GAM[#执行GAM]
xp.gam(xpdb)
## Summarize GAM[#总结GAM]
xp.summary()
## An Akaike plot of the results[#赤池图的结果]
xp.akaike.plot()
## Studentized residuals[#学生化残差]
xp.ind.stud.res()
## Individual influence on GAM fit[#GAM适合的个人影响力]
xp.ind.inf.fit(plot.ids=xpdb@Prefs@Gam.prefs$plot.ids)
## Individual influence on GAM terms[#GAM条款的个人影响力]
xp.ind.inf.terms(plot.ids=xpdb@Prefs@Gam.prefs$plot.ids)
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