R语言 chipseq包 diffPeakSummary()函数中文帮助文档(中英文对照)

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diffPeakSummary(chipseq)
diffPeakSummary()所属R语言包：chipseq

                                         A function to identify and produce summary statistics for differentially expressed peaks.
                                         一个功能识别并产生汇总统计差异表达的高峰。

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given two sets of peaks, this function combines them and summarizes the individual coverage vectors under the combined peak set.
由于两套峰，此功能相结合，并总结下个人保险向量合并峰集。


用法----------Usage----------


diffPeakSummary(ranges1, ranges2,
                viewSummary = list(sums = viewSums, maxs = viewMaxs))



参数----------Arguments----------

参数：ranges1
First set of peaks (typically an RleViewsList).
第一组峰（通常是一个RleViewsList）。


参数：ranges2
Second set of peaks (typically an RleViewsList).
第二组峰（通常是一个RleViewsList）。


参数：viewSummary
A list of the per peak summary functions.  
每峰汇总函数的列表。


值----------Value----------

A data.frame with one row for each peak in the combined data. The chromosome, start and stop nucleotide positions (+ strand) are given as are the summary statistics requested.
一个data.frame一排在合并后的数据为每个高峰。染色体，启动和停止核苷酸位置（股），以及所要求的汇总统计。


作者（S）----------Author(s)----------


D. Sarkar



举例----------Examples----------


data(cstest)
library(BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9)
seqlevels(cstest) <- seqlevels(Mmusculus)
seqlengths(cstest) <- seqlengths(Mmusculus)
## find peaks[＃找到峰]
findPeaks <- function(reads) {
  reads.ext <- resize(reads, width = 200)
  slice(coverage(reads.ext), lower = 8)
}
peakSummary <- diffPeakSummary(findPeaks(cstest$gfp), findPeaks(cstest$ctcf))

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注：
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注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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