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R语言 chipseq包 coverageplot()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-2-25 14:54:17 | 显示全部楼层 |阅读模式
coverageplot(chipseq)
coverageplot()所属R语言包:chipseq

                                         Plot coverage on a small interval.
                                         图覆盖一个小的时间间隔。

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

A function that plots one or two coverage vectors over a relatively small interval in the genome.
一个功能,在基因组相对较小的时间间隔超过一个或两个覆盖向量图。


用法----------Usage----------


coverageplot(peaks1, peaks2 = NULL, i = 1,
             xlab = "Position", ylab = "Coverage",
             opposite = TRUE, ...)



参数----------Arguments----------

参数:peaks1, peaks2
A set of peaks as described by ranges over a coverage vector.  
一峰集描述了一个覆盖向量的范围。


参数:i
Which peak to use.  
其中高峰期使用。


参数:xlab, ylab
Axis labels.  
轴标签。


参数:opposite
Logical specifying whether the two peaks should be plotted on opposite sides (appropriate for positive and negative strand peaks).  
逻辑指定是否应绘制反面两峰(适当的正面和负面链峰)。


参数:...
extra arguments.  
额外的参数。


作者(S)----------Author(s)----------



Deepayan Sarkar




举例----------Examples----------


cov <- Rle(c(1:10, seq(10, 1, -2), seq(1,5,2), 4:1), rep(1:2, 11))
peaks <- slice(cov, 3)
peaks.cov <- Views(cov, ranges(peaks))
peaks.cov.rev <- rev(peaks.cov)
coverageplot(peaks.cov, peaks.cov.rev, ylab = "Example")

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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