coverageplot(chipseq)
coverageplot()所属R语言包:chipseq
Plot coverage on a small interval.
图覆盖一个小的时间间隔。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A function that plots one or two coverage vectors over a relatively small interval in the genome.
一个功能,在基因组相对较小的时间间隔超过一个或两个覆盖向量图。
用法----------Usage----------
coverageplot(peaks1, peaks2 = NULL, i = 1,
xlab = "Position", ylab = "Coverage",
opposite = TRUE, ...)
参数----------Arguments----------
参数:peaks1, peaks2
A set of peaks as described by ranges over a coverage vector.
一峰集描述了一个覆盖向量的范围。
参数:i
Which peak to use.
其中高峰期使用。
参数:xlab, ylab
Axis labels.
轴标签。
参数:opposite
Logical specifying whether the two peaks should be plotted on opposite sides (appropriate for positive and negative strand peaks).
逻辑指定是否应绘制反面两峰(适当的正面和负面链峰)。
参数:...
extra arguments.
额外的参数。
作者(S)----------Author(s)----------
Deepayan Sarkar
举例----------Examples----------
cov <- Rle(c(1:10, seq(10, 1, -2), seq(1,5,2), 4:1), rep(1:2, 11))
peaks <- slice(cov, 3)
peaks.cov <- Views(cov, ranges(peaks))
peaks.cov.rev <- rev(peaks.cov)
coverageplot(peaks.cov, peaks.cov.rev, ylab = "Example")
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注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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