WMBrukerParser-package(WMBrukerParser)
WMBrukerParser-package()所属R语言包:WMBrukerParser
William and Mary Parser for Bruker-Ultraflex TOF-MS Data
威廉和玛丽·布鲁克的UltraFlex TOF-MS数据分析器
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
The package parses Bruker-Ultraflex TOF mass spectrometry data and experimental parameter files into R structures for further signal processing and statistical analysis.
包布鲁克的UltraFlex TOF质谱数据和进一步的信号处理和统计分析的实验参数文件到R的结构分析。
Details
详细信息----------Details----------
</table> The package contains two routines. The core routine, BrukerParser, reads binary TOF data (obtained using either Linear or Reflector mode) and associated experimental parameter files, and parses data and meta-data into R structures, tofList and tofListMetaData. This involves accessing files in different locations within a data directory tree and reading different file formats. The second routine, ParseAndSave calls the BrukerParser routine as directed by the parameter list, ParserParams (provided in an OptionsAndParameters.txt file), and saves the tofList and tofListMetaData structures that are returned in .Rdat files. Parameters in OptionsAndParameters can be edited to select options for parsing data from multiple bioprocessor runs, concatenating parsed data and printing memory usage information.
</ TABLE>该软件包包含两个例程。的核心的例程,BrukerParser,读取二进制TOF数据(使用线性或反射模式获得的)和相关的实验参数文件,并解析成R的构筑物,tofList和tofListMetaData的数据和元数据。这涉及不同位置的文件在数据目录树访问和读取不同的文件格式。第二个例程,ParseAndSave调用BrukerParser常规导演的的参数列表中,ParserParams“(提供在OptionsAndParameters.txt文件),和,节省了tofList和tofListMetaData结构中返回。RDAT文件。参数可以编辑在OptionsAndParameters的选择选项分析数据从多个bioprocessor运行,串联解析数据和打印内存使用信息。
(作者)----------Author(s)----------
William Cooke, Maureen Tracy and Dariya Malyarenko,
College of William and Mary
Maintainer: William Cooke <wecook@wm.edu>
参见----------See Also----------
BrukerParser,ParserParams, ParseAndSave, tofList, tofListMetaData
BrukerParser,ParserParams,ParseAndSave,tofList,tofListMetaData
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