R语言 WGCNA包 unsignedAdjacency()函数中文帮助文档(中英文对照)

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unsignedAdjacency(WGCNA)
unsignedAdjacency()所属R语言包：WGCNA

                                         Calculation of unsigned adjacency
                                         计算未签名的邻接

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Calculation of the unsigned network adjacency from expression data. The restricted set of parameters for this function should allow a faster and less memory-hungry calculation.
网络邻接表达数据的无符号的计算。有限的一组参数，这个功能应该允许更快，更消耗内存的计算。


用法----------Usage----------


unsignedAdjacency(
  datExpr,
  datExpr2 = NULL,
  power = 6,
  corFnc = "cor", corOptions = "use = 'p'")



参数----------Arguments----------

参数：datExpr
expression data. A data frame in which columns are genes and rows ar samples. Missing values are ignored.  
表达数据。一个数据框的基因，在哪些列和行AR样本。缺少的值将被忽略。


参数：datExpr2
optional specification of a second set of expression data. See details.  
可选规范的表达数据的第二组。查看详细信息。


参数：power
soft-thresholding power for network construction.  
软阈值功率的网络建设。


参数：corFnc
character string giving the correlation function to be used for the adjacency calculation. Recommended choices are "cor" and "bicor", but other functions can be used as well.  
字符字符串，给出要用于邻接计算的相关函数。推荐选择是"cor"和"bicor"，以及其他功能都可以使用。


参数：corOptions
  character string giving further options to be passed to the correlation function  
提供进一步的选项传递的相关函数的字符串


Details

详细信息----------Details----------

The correlation function will be called with arguments datExpr, datExpr2 plus any extra arguments given in corOptions. If datExpr2 is NULL,  the standard correlation functions will calculate the corelation of columns in datExpr.
的相关函数将被调用带参数的datExpr, datExpr2加任何额外的参数在corOptions。如果datExpr2NULL，标准相关功能将计算列的相关性实证datExpr。


值----------Value----------

Adjacency matrix of dimensions n*n, where n is the number of genes in datExpr.
邻接矩阵尺寸n*n，其中n是基因的数目在datExpr。


（作者）----------Author(s)----------


Steve Horvath and Peter Langfelder



参考文献----------References----------

Analysis", Statistical Applications in Genetics and Molecular Biology: Vol. 4: No. 1, Article 17

参见----------See Also----------

adjacency
adjacency

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