R语言 WGCNA包 standardScreeningNumericTrait()函数中文帮助文档(中英文对照)

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standardScreeningNumericTrait(WGCNA)
standardScreeningNumericTrait()所属R语言包：WGCNA

                                         Standard screening for numeric traits
                                         数字特征的标准筛选

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Standard screening for numeric traits based on Pearson correlation.
根据Pearson相关数字特征的标准筛选。


用法----------Usage----------


standardScreeningNumericTrait(datExpr, yNumeric, corFnc = cor,
                              corOptions = list(use = 'p'),
                              alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
                              qValues = TRUE,
                              areaUnderROC = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数：datExpr
data frame containing expression data (or more generally variables to be screened), with rows corresponding to samples and columns to genes (variables)  
数据框包含的基因（变量）的表达数据的（或更一般的变量来进行筛选），对应于样品和列与行


参数：yNumeric
a numeric vector giving the trait measurements for each sample  
给性状测量每个样品的一个数值向量


参数：corFnc
correlation function.  Defaults to Pearson correlation but can also be bicor.  
相关函数。默认为Pearson相关，但也可以bicor。


参数：corOptions
list specifying additional arguments to be passed to the correlation function given by corFnc.  
列表中的相关函数的corFnc指定额外的参数传递。


参数：alternative
alternative hypothesis for the correlation test
另一种假设的相关测试


参数：qValues
logical: should q-values be calculated?
逻辑：Q值计算出来的？


参数：areaUnderROC
logical: should are under the receiver-operating curve be calculated?
逻辑：应在接收器的工作曲线计算出来的？


Details

详细信息----------Details----------

The function calculates the correlations, associated p-values, area under the ROC, and q-values
该函数将计算的相关性，关联的p-值的ROC曲线下的面积，和q-值


值----------Value----------

Data frame with the following components:
数据框与以下组件：


参数：ID
Gene (or variable) identifiers copied from colnames(datExpr)
基因（或变量）的标识符复制到colnames(datExpr)


参数：cor
correlations of all genes with the trait
的所有基因的相关性的特征


参数：Z
Fisher Z statistics corresponding to the correlations
费舍尔Z统计量对应的相关性


参数：pvalueStudent
Student p-values of the correlations
学生的p值的相关性


参数：qvalueStudent
(if input qValues==TRUE) q-values of the correlations calculated from the p-values
（如果输入qValues==TRUE）q中值的相关性计算出的p值


参数：AreaUnderROC
(if input areaUnderROC==TRUE) area under the ROC
（如果输入areaUnderROC==TRUE）的ROC曲线下面积


参数：nPresentSamples
number of samples present for the calculation of each association.  
存在的样本数为每个关联的计算。


（作者）----------Author(s)----------



Steve Horvath




参见----------See Also----------

standardScreeningBinaryTrait, standardScreeningCensoredTime
standardScreeningBinaryTrait，standardScreeningCensoredTime

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注：
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