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R语言 WGCNA包 plotCor()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:21:36 | 显示全部楼层 |阅读模式
plotCor(WGCNA)
plotCor()所属R语言包:WGCNA

                                        Red and Green Color Image of Correlation Matrix
                                         红色和绿色的色彩图像的相关系数矩阵

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function produces a red and green color image of a correlation matrix using an RGB color specification. Increasingly positive correlations are represented with reds of increasing intensity, and increasingly negative correlations are represented with greens of increasing intensity.  
该函数产生的红色和绿色的彩色图像的相关矩阵,使用一个RGB颜色规范。代表红魔的强度的增加,越来越多的正相关关系,并表示绿色强度的增加越来越多的负相关关系。


用法----------Usage----------


plotCor(x, new=FALSE, nrgcols=50, labels=FALSE, labcols=1, title="", ...)



参数----------Arguments----------

参数:x
a matrix of numerical values.
数值的矩阵。


参数:new
If new=F, x must already be a correlation matrix. If new=T, the correlation matrix for the columns of x is computed and displayed in the image.  
如果new=F,x必须已经是一个相关矩阵。如果new=T,x列的相关矩阵的计算,并显示在图像上。


参数:nrgcols
the number of colors (>= 1) to be used in the red and green palette.  
中要使用的红色和绿色的调色板的颜色数(> = 1)。


参数:labels
vector of character strings to be placed at the tickpoints, labels for the columns of x.  
向量的字符串的tickpoints,标签被放置在列x。


参数:labcols
colors to be used for the labels of the columns of x. labcols can have either length 1, in which case all the labels are displayed using the same color, or the same length as labels, in which case a color is specified for the label of each column of x.  
用于标签的列x颜色。 labcols可以有任一长度为1,在这种情况下,所有的标签都使用相同的颜色显示,或相同的长度labels,在这种情况下,一个颜色指定的标签的每个列 x。


参数:title
character string, overall title for the plot.
字符串,图的总冠军。


参数:...
graphical parameters may also be supplied as arguments to the function (see par). For comparison purposes,  it is good to set zlim=c(-1,1).
图形参数也可以提供作为参数的函数(见par)。为了便于比较,它是好zlim=c(-1,1)。


(作者)----------Author(s)----------



Sandrine Dudoit, <a href="mailto:sandrine@stat.berkeley.edu">sandrine@stat.berkeley.edu</a>




参见----------See Also----------

plotMat,rgcolors.func, cor.na, cor, image,
plotMat,rgcolors.func,cor.na,cor,image,

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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