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R语言 WGCNA包 networkScreeningGS()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:19:11 | 显示全部楼层 |阅读模式
networkScreeningGS(WGCNA)
networkScreeningGS()所属R语言包:WGCNA

                                         Network gene screening with an external gene significance measure
                                         网络基因的筛选与外源基因意义的措施

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This function blends standard and network approaches to selecting genes (or variables in general) with high gene significance
此功能融合标准和网络的方法来选择基因(或一般的变量)与高基因意义


用法----------Usage----------


networkScreeningGS(datExpr, datME, GS, oddPower = 3, blockSize = 1000, minimumSampleSize = ..minNSamples,
addGS = TRUE)



参数----------Arguments----------

参数:datExpr
data frame of expression data  
表达数据的数据框


参数:datME
data frame of module eigengenes  
数据框的模块特征基因


参数:GS
numeric vector of gene significances  
数字向量的基因意义


参数:oddPower
odd integer used as a power to raise module memberships and significances  
奇整数,用于为动力,以提高模块的成员资格和意义


参数:blockSize
block size to use for calculations with large data sets  
块的大小,使用大型数据集的计算


参数:minimumSampleSize
minimum acceptable number of samples. Defaults to the default minimum number of samples used throughout the WGCNA package, currently 4.
最低可接受的数量的样本。默认为整个WGCNA包,目前使用的样品的默认数量。


参数:addGS
logical: should gene significances be added to the screening statistics?
逻辑:基因意义的筛选统计?


Details

详细信息----------Details----------

This function should be considered experimental. It takes into account both the "standard" and the network measures of gene importance for the trait.
这个函数应该被认为是实验性的。需要兼顾“标准”的基因为特征的重要性和网络的措施。


值----------Value----------


参数:GS.Weighted
weighted gene significance  
加权基因意义


参数:GS
copy of the input gene significances (only if addGS=TRUE)
复制的的输入基因意义(只有addGS=TRUE)


(作者)----------Author(s)----------


Steve Horvath



参见----------See Also----------

networkScreening, automaticNetworkScreeningGS
networkScreening,automaticNetworkScreeningGS

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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