R语言 WGCNA包 matchLabels()函数中文帮助文档(中英文对照)

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matchLabels(WGCNA)
matchLabels()所属R语言包：WGCNA

                                         Relabel module labels to best match the given reference labels
                                         重新标记模块的标签，以更好地满足给定的参考标签

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Given a source and  reference vectors of module labels, the function produces a module labeling that is equivalent to source, but individual modules are re-labeled so that modules with significant overlap in source and reference have the same labels.
由于一个source和reference向量函数生成一个模块的模块标签，标签是等价于source，但各个模块的重新标记，使模块具有显着的重叠source和reference有相同的标签。


用法----------Usage----------


matchLabels(source, reference, pThreshold = 5e-2)



参数----------Arguments----------

参数：source
a vector or a matrix of reference labels. The labels may be numeric or character.  
矢量或矩阵的参考标记。该标记可以是数字或字符。


参数：reference
a vector of reference labels.  
参考标记的向量。


参数：pThreshold
threshold of Fisher's exact test for considering modules to have a significant overlap.  
Fisher的精确检验，考虑模块，有一个显着的重叠阈值。


Details

详细信息----------Details----------

Each column of source is treated separately. Source and reference labels are assumed to be of the same type, that is noth should be either numeric or character. If the labels are character, they are assumed to be color labels such as the ones returned by standardColors.
每列source分开处理。源和参考标签被假定是相同的类型，即是，诺斯应是数字或字符。如果标签的字符，它们被假定，如返回standardColors彩色标签。

The function calculates the overlap of the source and reference modules using Fisher's exact test. It then attempts to relabel source modules such that modules with the highest overlap with the reference modules have the same color. Where this is not possible (for example because one reference module has the highest overlap with two source modules), the source modules will be relabeled using labels that are not present among the reference labels.
该函数计算重叠source和reference模块采用Fisher精确检验。然后，它尝试进行标记source模块的重叠，最高的reference的模块，该模块具有相同的颜色。这是不可能的（例如，因为一个参考模块具有最高的重叠两个源模块），源模块将被重新标注使用标签的参考标签之间是不存在的。


值----------Value----------

A vector (if the input source labels are a vector) or a matrix (if the input source labels are a matrix) of the new labels.
的向量（如果输入source标签是一个向量）或矩阵（如果输入source标签是一个矩阵）的新的标签。


（作者）----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参见----------See Also----------

standardColors
standardColors

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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