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R语言 WGCNA包 ImmunePathwayLists()函数中文帮助文档(中英文对照)

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发表于 2012-10-1 21:15:08 | 显示全部楼层 |阅读模式
ImmunePathwayLists(WGCNA)
ImmunePathwayLists()所属R语言包:WGCNA

                                        Immune Pathways with Corresponding Gene Markers
                                         免疫途径与相应的基因标记

                                         译者:生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

This matrix gives a predefined set of marker genes for many immune response pathways, as assembled by Brian Modena (a member of Daniel R Salomon's lab at Scripps Research Institute), and colleagues.  It is used with userListEnrichment to search user-defined gene lists for enrichment.
这个矩阵给出了一组预定义的标记基因,对于许多免疫反应的途径,布赖恩摩德纳(斯克里普斯研究所的成员丹尼尔ŕSalomon的实验室),和他的同事组装。它是用来与userListEnrichment搜索用户定义的基因列表富集。


用法----------Usage----------


data(ImmunePathwayLists)



格式----------Format----------

A 3597 x 2 matrix of characters containing Gene / Category pairs.  The first column (Gene) lists genes corresponding to a given category (second column).  Each Category entry is of the form <Immune Pathway>__ImmunePathway.  Note that the matrix is sorted first by Category and then by Gene, such that all genes related to the same category are listed sequentially.
一个3597×2矩阵的字符,包含基因/类别对。的第一列(基因)的列表对应于一个给定的类别(第二列)的基因。每个分类条目是在的形式<Immune Pathway> __ImmunePathway的。请注意,矩阵排序第一个类别,然后通过基因的同一类别的所有相关基因的顺序列出。


源----------Source----------

For more information about this list, please see userListEnrichment
有关此列表的更多信息,请参阅userListEnrichment


实例----------Examples----------


data(ImmunePathwayLists)
head(ImmunePathwayLists)

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注:
注1:为了方便大家学习,本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成,仅供个人R语言学习参考使用,生物统计家园保留版权。
注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
注3:如遇到不准确之处,请在本贴的后面进行回帖,我们会逐渐进行修订。
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