R语言 WGCNA包 exportNetworkToVisANT()函数中文帮助文档(中英文对照)

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exportNetworkToVisANT(WGCNA)
exportNetworkToVisANT()所属R语言包：WGCNA

                                         Export network data in format readable by VisANT
                                         出口网络中的数据格式，可读的VisANT

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Exports network data in a format readable and displayable by the VisANT software.
出口网络中的数据的格式可读和可显示由VisANT软件。


用法----------Usage----------


exportNetworkToVisANT(
  adjMat,
  file = NULL,
  weighted = TRUE,
  threshold = 0.5,
  probeToGene = NULL)



参数----------Arguments----------

参数：adjMat
adjacency matrix of the network to be exported.  
邻接矩阵的网络出口。


参数：file
character string specifying the file name of the file in which the data should be written. If not given, no file will be created. The file is in a plain text format.  
指定在其中的数据应该被写入的文件的文件名的字符串。如果没有给出，没有文件将被创建。该文件是一个纯文本格式。


参数：weighted
logical: should the exported network by weighted?  
逻辑：应出口网络的加权吗？


参数：threshold
adjacency threshold for including edges in the output.  
包括在输出中的边缘邻接的阈值。


参数：probeToGene
optional specification of a conversion between probe names (that label columns and rows of adjacency) and gene names (that should label nodes in the output).  
可选规范的探针名称之间的转换（即标签adjacency）和基因名称（应该在输出中的节点标记）的列和行。


Details

详细信息----------Details----------

The adjacency matrix is checked for validity. The entries can be negative, however. The adjacency matrix is expected to also have valid names or dimnames[[2]] that represent the probe names of the corresponding edges.
邻接矩阵进行有效性检查。条目可以是负的，但是。邻接矩阵的预期也有有效的names或dimnames[[2]]代表的相应边缘的探针名称。

Whether the output is a weighted network or not, only edges whose (absolute value of) adjacency are above threshold will be included in the output.
的输出是否是一个加权网络或没有，只有边缘的（的绝对值）邻接上述的threshold将包含在输出中。

If probeToGene is given, it is expected to have two columns, the first one corresponding to the probe names, the second to their corresponding gene names that will be used in the output.
如果probeToGene被给出，它预计将有两列探针名称对应的，第一个，第二个到其相应的基因的名称，将用于在输出中。


值----------Value----------

A data frame containing the network information suitable as input to VisANT. The same data frame is also written into a file specified by file, if given.
一个数据框的网络信息适合输入到VisANT的。相同的数据框也将被写入到一个文件中指定的file，如果给定的。


（作者）----------Author(s)----------


Peter Langfelder



参考文献----------References----------

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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