cutreeStatic(WGCNA)
cutreeStatic()所属R语言包:WGCNA
Constant-height tree cut
的恒高树切
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Module detection in hierarchical dendrograms using a constant-height tree cut. Only branches whose size is at least minSize are retained.
模块检测层次的树状图,使用的是恒高树砍。只有分支的大小至少minSize保留。
用法----------Usage----------
cutreeStatic(dendro, cutHeight = 0.9, minSize = 50)
参数----------Arguments----------
参数:dendro
a hierarchical clustering dendrogram such as returned by hclust.
分层聚类树状图如返回hclust。
参数:cutHeight
height at which branches are to be cut.
高度分支将会被削减。
参数:minSize
minimum number of object on a branch to be considered a cluster.
的对象被认为是一个聚类的一个分支上的最小数目。
Details
详细信息----------Details----------
This function performs a straightforward constant-height cut as implemented by cutree, then calculates the number of objects on each branch and only keeps branches that have at least minSize objects on them.
这个函数执行一个简单的恒定高度削减所实现的cutree,然后计算每个分支上的对象的数量,只保留至少有minSize对象对他们的分支机构。
值----------Value----------
A numeric vector giving labels of objects, with 0 meaning unassigned. The largest cluster is conventionally labeled 1, the next largest 2, etc.
指定给标签的对象,0表示一个数字矢量。最大的聚类以往标记为1,下一个最大的2,等等。
(作者)----------Author(s)----------
Peter Langfelder
参见----------See Also----------
hclust for hierarchical clustering, cutree and cutreeStatic for other constant-height branch cuts, standardColors to convert
hclust层次聚类,cutree和cutreeStatic其他的恒定高度分支切割,standardColors转换
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