corAndPvalue(WGCNA)
corAndPvalue()所属R语言包：WGCNA
Calculation of correlations and associated p-values
计算的相关性，相关的p-值
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A faster, one-step calculation of Student correlation p-values for multiple correlations, properly taking into account the actual number of observations.
更快的，一步到位的学生相关的p值复相关系数的计算，适当地考虑到实际的若干意见。
用法----------Usage----------
corAndPvalue(x, y = NULL,
use = "pairwise.complete.obs",
alternative = c("two.sided", "less", "greater"),
...)
参数----------Arguments----------
参数：x
a vector or a matrix
矢量或矩阵
参数：y
a vector or a matrix. If NULL, the correlation of columns of x will be calculated.
的矢量或矩阵。如果NULL，列x的相关性将被计算。
参数：use
determines handling of missing data. See cor for details.
确定处理丢失的数据。见cor的详细信息。
参数：alternative
specifies the alternative hypothesis and must be (a unique abbreviation of) one of "two.sided", "greater" or "less". the initial letter. "greater" corresponds to positive association, "less" to negative association.
指定替代假说和，必须（一个独特的缩写）"two.sided"，"greater"或"less"。的首字母。 "greater"对应于正相关，"less"呈负相关。
参数：...
other arguments to the function cor.
其他参数功能cor。
Details
详细信息----------Details----------
The function calculates correlations of a matrix or of two matrices and the corresponding Student p-values. The output is not as full-featured as cor.test, but can work with matrices as input.
该函数计算的矩阵或两个矩阵和相应的学生的p-值的相关性。输出是不齐全的特色作为cor.test，但可以作为输入矩阵。
值----------Value----------
A list with the following components, each a matrix:
与以下组件的列表，每一个矩阵：
参数：cor
the calculated correlations
计算出的相关性
参数：p
the Student p-values corresponding to the calculated correlations
学生p-值对应于所计算的相关性
参数：Z
Fisher transforms of the calculated correlations
费舍尔变换计算出的相关性
参数：t
Student t statistics of the calculated correlations
学生的t统计量的计算相关性
参数：nObs
Numbers of observations for the correlation, p-values etc.
数的观测值的相关性，p值等
（作者）----------Author(s)----------
Peter Langfelder and Steve Horvath
参考文献----------References----------
Fast R Functions for Robust Correlations and Hierarchical Clustering. Journal of Statistical Software, 46(11), 1-17. http://www.jstatsoft.org/v46/i11/
参见----------See Also----------
cor for calculation of correlations only;
cor只用于计算的相关性;
cor.test for another function for significance test of correlations
cor.test的另一功能的显着性检验的相关性
实例----------Examples----------
# generate random data with non-zero correlation[生成随机数据与非零相关]
set.seed(1);
a = rnorm(100);
b = rnorm(100) + a;
x = cbind(a, b);
# Call the function and display all results[调用该函数，并显示所有结果]
corAndPvalue(x)
# Set some components to NA[将某些组件NA]
x[c(1:4), 1] = NA
corAndPvalue(x)
# Note that changed number of observations.[请注意，改变的若干意见。]
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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
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发表于 2012-10-1 21:11:12
