R语言 ChIPpeakAnno包 write2FASTA()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

write2FASTA(ChIPpeakAnno)
write2FASTA()所属R语言包：ChIPpeakAnno

                                         write sequences to a file in fasta format
                                         FASTA格式的文件中写入序列

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

write the sequences obtained from getAllPeakSequence to a file in fasta format leveraging writeFASTA in Biostrings package. FASTA is a simple file format for biological sequence data. A FASTA format file contains one or more sequences and there is a header line which begins with a > proceeding each sequence.
写入FASTA格式凭借Biostrings包writeFASTA的从getAllPeakSequence到一个文件中获得的序列。 FASTA格式是一种简单的生物序列数据的文件格式。 FASTA格式文件包含一个或多个序列，并有一个标题行与此案>每个序列开始。


用法----------Usage----------


write2FASTA(mySeq, file="", width=80)



参数----------Arguments----------

参数：mySeq
RangedData with varibles name and sequence ,e.g., results obtained from getAllPeakSequence  
肌的名称和顺序，例如RangedData，结果从getAllPeakSequence


参数：file
Either a character string naming a file or a connection open for reading or writing. If "" (the default for write2FASTA), then the function writes to the standard output connection (the console) unless redirected by sink
无论是字符串命名的文件或读或写打开连接。 “”如果（默认write2FASTA），然后函数写入到标准输出连接（控制台），除非汇重定向


参数：width
The maximum number of letters per line of sequence  
的字母顺序每行的最大数量


值----------Value----------

Output as FASTA file format to the naming file or the console.
FASTA格式的文件格式来命名文件或控制台输出。


作者（S）----------Author(s)----------


Lihua Julie Zhu



举例----------Examples----------


peaksWithSequences = RangedData(IRanges(start=c(1000, 2000), end=c(1010, 2010),
names=c("id1", "id2")), sequence= c("CCCCCCCCGGGGG", "TTTTTTTAAAAAA"))
write2FASTA(peaksWithSequences, file="testseq.fasta", width=50)

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
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