ped(waffect)
ped()所属R语言包：waffect
Genotypic dataset in PED format
在PED格式的基因型数据集
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This dataset contains the genotypes of 2000 SNPs to be used with the tutorial for assessing the statistical power of GWAs with waffect (see the vignette). It has 100 rows (one for each individual) and 2007 columns:
此数据集包含2000个SNP位点的基因型，可用于本教程评估的统计功率的GWAS waffect（见的小插曲）。它有100行（每个人）和2007年列：
fam_id: family ID, here an integer from 1 to 100
fam_id：系列ID，从1到100的整数在这里
ind_id: individual ID, an integer from 1 to 100
ind_id：个别ID，从1到100的整数;
pat_id: paternal ID, here a dummy variable set to 0 for all individuals
pat_id：父亲的ID，这里的虚拟变量设置为0，所有个人
mat_id: maternal ID, dummy variable
mat_id：产妇ID，虚拟变量
sex: all females (coded by 2)
性别：女性（编码2）
pheno: observed phenotypes; codes: case = 2, control = 1.
苯酚：观察表型;代码：= 1 = 2，控制。
Genotypes (column 7 onwards) are biallelic, one allele for each column. For instance, columns 7 and 8 contain the two alleles for SNP1 and columns 9 and 10 contain the alleles for SNP2. Before using this dataset with PLINK it is necessary to save it into a file with extension .ped (see the vignette). The genotypes were obtained from public data released by the 1000 Genomes Projects.
基因型（列7起），双等位基因，其中一个等位基因为每列。比如，第7和第8列包含的两个等位基因SNP1和列9和10包含了等位基因SNP2。在使用该数据集PLINK有必要将它保存到一个文件的扩展名。PED（见小插曲）。千人基因组项目从公众公布的数据显示，获得的基因型。
用法----------Usage----------
data(ped)
格式----------Format----------
A table with 100 rows and 2007 columns.
100行和2007年列一个表。
源----------Source----------
1000 Genomes, A Deep Catalogue of Human Genetic Variation; http://www.1000genomes.org
1000个基因组，人类基因变异的深层目录; http://www.1000genomes.org
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发表于 2012-10-1 16:46:01
