R语言 ChemmineR包 groups()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

groups(ChemmineR)
groups()所属R语言包：ChemmineR

                                         Enumeration of Functional Groups and Atom Neighbors
                                         枚举的功能组和Atom邻居

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns frequency information of functional groups in molecules provided as SDF or SDFset objects. Alternatively, the function can return for each atom its atom/bond neighbor information.
返回SDF或SDFset对象提供的分子功能组别的频率信息。另外，函数可以返回每个原子的原子/债券邻居信息。


用法----------Usage----------


groups(x, groups = "fctgroup", type)



参数----------Arguments----------

参数：x
SDF or SDFset containers  
SDF或SDFset容器


参数：groups
if groups="fctgroup", frequencies of functional groups are returned; if groups="neighbors", atom/bond neighbor information is returned.   
如果groups="fctgroup"，功能组别的频率返回; groups="neighbors"如果，原子/债券的邻居信息返回。


参数：type
if type="all", then the complete neighbor information is generated for each atom in a molecule; if type="count", the neighbors are enumerated in a list and if type="countMA", then the counts of atom neighbors or functional groups are returned in a frequency matrix.   
如果type="all"，然后完整的邻居信息的每一个分子中的原子产生; type="count"如果，邻居们列举列表中，如果type="countMA"，然后原子邻居计数或功能团体中返回的频率矩阵。


Details

详情----------Details----------

At this point this function is in an experimental stage.
在这一点上，这个功能是在试验阶段。


值----------Value----------

...
...


作者（S）----------Author(s)----------



Thomas Girke




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

...
...


举例----------Examples----------


## Instances of SDFset class[＃实例SDFset类，]
data(sdfsample)
sdfset <- sdfsample

## Enumerate functional groups[＃枚举功能组别]
groups(sdfset[1:20], groups="fctgroup", type="countMA")

## Report atom/bond neighbors[＃报告原子/债券的邻居]
groups(sdfset[1:4], groups="neighbors", type="countMA")
groups(sdfset[1:4], groups="neighbors", type="count")
groups(sdfset[1:4], groups="neighbors", type="all")

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注：
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