R语言 ChemmineR包 atomcount()函数中文帮助文档(中英文对照)

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atomcount(ChemmineR)
atomcount()所属R语言包：ChemmineR

                                         Molecular property functions
                                         分子属性函数

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Functions to compute molecular properties: weight, formula, atom frequencies, etc.
计算分子特性的功能：重量，公式，原子频率等。


用法----------Usage----------


atomcount(x, addH = FALSE, ...)

atomcountMA(x, ...)

MW(x, mw=atomprop, ...)

MF(x, ...)



参数----------Arguments----------

参数：x
object of class SDFset or SDF  
对象的类SDFset或SDF


参数：mw
data.frame with atomic weights; imported by default with data(atomprop); supports custom data sets  
data.frame原子量;默认情况下，用数据（atomprop）进口;支持设置自定义数据


参数：addH
'addH = TRUE' should be passed on to any of these function to add hydrogens that are often not specified in SD files  
“ADDH = TRUE”，应通过对这些功能的任何补充，往往没有SD文件中指定的氢


参数：...
Arguments to be passed to/from other methods.  
参数被传递到/从其他方法。


Details

详情----------Details----------

...
...


值----------Value----------


参数：named vector
MW and MF
MW和MF


参数：list
atomcount
atomcount


参数：matrix
atomcountMA
atomcountMA


作者（S）----------Author(s)----------



Thomas Girke




参考文献----------References----------



参见----------See Also----------

Functions: datablock, datablocktag
功能：datablock，datablocktag


举例----------Examples----------



## Instance of SDFset class[＃SDFset类的实例]
data(sdfsample)
sdfset <- sdfsample

## Compute properties; to consider missing hydrogens, set 'addH = TRUE'[＃计算性能;考虑缺少氢，集ADDH = TRUE“]
MW(sdfset[1:4], addH = FALSE)
MF(sdfset[1:4], addH = FALSE)
atomcount(sdfset[1:4], addH = FALSE)
propma <- atomcountMA(sdfset[1:4], addH = FALSE)
boxplot(propma, main="Atom Frequency")

## Example for injecting a custom matrix/data frame into the data block of an[＃举例注入一个自定义的矩阵/数据框的数据块]
## SDFset and then writing it to an SD file[＃SDFset然后它写入到SD文件]
props <- data.frame(MF=MF(sdfset), MW=MW(sdfset), atomcountMA(sdfset))
datablock(sdfset) <- props
view(sdfset[1:4])
# write.SDF(sdfset[1:4], file="sub.sdf", sig=TRUE, cid=TRUE)[write.SDF（sdfset [1:4]，文件=“sub.sdf”，SIG = TRUE，CID = TRUE时）]


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