R语言 ChemmineR包 ap()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

ap(ChemmineR)
ap()所属R语言包：ChemmineR

                                         Return atom pair component of AP/APset
                                         返回原子对元件AP / APset

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns atom pair component of objects of class AP or APset as list of vectors.
返回对组件原子AP或APset向量列表类的对象的。


用法----------Usage----------


ap(x)



参数----------Arguments----------

参数：x
Object of class AP and APset  
对象的类AP和APset


Details

详情----------Details----------

...
...


值----------Value----------


参数：List
with one to many of following components:
以下组件：


参数：numeric
atom pairs  
原子对


作者（S）----------Author(s)----------



Thomas Girke




参考文献----------References----------

in 2D fragment-based similarity searching: comparison of structural descriptors and similarity coefficients", J Chem Inf Comput Sci.

参见----------See Also----------

Functions: SDF2apcmp, apset2descdb, cmp.search, cmp.similarity
功能：SDF2apcmp，apset2descdb，cmp.search，cmp.similarity


举例----------Examples----------



## Instance of SDFset class[＃SDFset类的实例]
data(sdfsample)
sdfset <- sdfsample[1:50]
sdf <- sdfset[[1]]

## Compute atom pair library[＃计算原子对库]
ap <- sdf2ap(sdf)
(apset <- sdf2ap(sdfset))
view(apset[1:4])

## Return main components of APset object[＃返回的APset对象的主要组成部分]
cid(apset[1:4]) # compound IDs[化合物的ID]
ap(apset[1:4]) # atom pair descriptors[原子对描述]

## Return atom pairs in human readable format[＃返回原子对人类可读的格式]
db.explain(apset[1])


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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。