R语言 charm包 validatePd()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

validatePd(charm)
validatePd()所属R语言包：charm

                                         Validate a sample description file for two-color microarray data
                                         两色的微阵列数据的验证样品描述文件

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Checks a sample description file describing two-color arrays for proper formatting and if requested guesses column numbers for file names, sample labels and group labels.
检查样本描述文件，描述两色阵列的格式是否正确，如要求猜测文件名，样品标签和组标签列数。


用法----------Usage----------


validatePd(pd, fileNameColumn, sampleNameColumn, groupColumn,
        ut = "_532.xys", md = "_635.xys")



参数----------Arguments----------

参数：pd
A data frame containing the sample description table  
一个数据框包含样本描述表


参数：fileNameColumn
Number or name of column containing file names (optional)  
列包含文件名的编号或名称（可选）


参数：sampleNameColumn
Number or name of column containing sample names (optional)  
列名称含有样品的编号或名称（可选）


参数：groupColumn
Number or name of column containing group labels (optional)
数或列包含组标签的名称（可选）


参数：ut
the file ending that designates untreated channel files  
指定未处理通道文件的文件结束


参数：md
the file ending that designates methyl-depleted channel files  
指定甲贫通道文件的文件结束


Details

详情----------Details----------

This function checks the formatting of a sample description file to make sure it has suitable columns for file names, sample names and (optionally) group labels. The sample description file should have one line per channel, i.e. two lines per sample corresponding to the red and green channel data files. Values in the sample name column are used to pair the two channels together. If fileNameColumn, sampleNameColumn and/or groupColumn are unspecified a guess will be made.
这个函数检查一个示例描述文件的格式，以确保有合适的文件名称，样品名称和（可选）组标签列。样本描述文件应该有一条线，每通道，即每样两个线对应红色和绿色通道的数据文件。在样品名称“列中的值是用来一起配对的两个通道。如果fileNameColumn，sampleNameColumn和/或groupColumn的是不确定的猜测将会作出修改。


值----------Value----------

If the input data frame is valid: a list containing the fileNameColumn, sampleNameColumn and groupColumn. If the input data frame is invalid: FALSE
如果输入的数据框是有效的：一个列表，包含fileNameColumn，sampleNameColumn和groupColumn。如果输入的数据框是无效：FALSE


作者（S）----------Author(s)----------



Martin Aryee <aryee@jhu.edu>




参见----------See Also----------

readCharm
readCharm


举例----------Examples----------


# See dmrFdr[看到dmrFdr]

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。