R语言 charm包 spatialAdjust()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

spatialAdjust(charm)
spatialAdjust()所属R语言包：charm

                                         Correct spatial artifacts
                                         正确的空间文物

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Remove spatial artifacts from microarray data stored in TilingFeatureSet objects
从芯片的数据存储在TilingFeatureSet对象的空间文物


用法----------Usage----------


spatialAdjust(dat, copy=TRUE, blockSize, theta = 1)



参数----------Arguments----------

参数：dat
TilingFeatureSet  
TilingFeatureSet


参数：copy
Only relevant when using disk-backed objects. If TRUE a copy will be made leaving the original object (dat) unchanged. The input object will not be preserved if copy=FALSE
只有相关时使用的磁盘备份的对象。如果是TRUE副本将离开原来的对象（DAT）不变。输入对象将不会被保留，如果复制= FALSE


参数：blockSize
The array is divided into a series of blockSize x blockSize rectangular blocks and the average signal level calculated for each. If blockSize is unspecified a size is chosen that gives about 1250 probes per block.   
阵列分为一系列的BLOCKSIZE x BLOCKSIZE矩形块和每个计算的平均信号电平。如果未指定BLOCKSIZE大小选择，提供了约1250每块探针。


参数：theta
smoothing parameter  
平滑参数


Details

详情----------Details----------

The array is divided into a set of blockSize x blockSize squares. A kernel smoother is then used to even out spatial artifacts.
阵列分为的BLOCKSIZE x BLOCKSIZE广场的一套。内核顺畅，然后用连空间文物。


值----------Value----------

a TilingFeatureSet
1 TilingFeatureSet


作者（S）----------Author(s)----------



Martin Aryee <aryee@jhu.edu>




举例----------Examples----------


# See normalizeBetweenSamples[看到normalizeBetweenSamples]

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注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。