readCharm(charm)
readCharm()所属R语言包：charm
Read in McrBC/CHARM DNA methylation microarray data
阅读McrBC /魅力的DNA甲基化微阵列数据
译者：生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Read in DNA methylation microarray data from the McrBC/CHARM platform
DNA甲基化微阵列数据读取McrBC /魅力的平台
用法----------Usage----------
readCharm(files, path = ".", ut = "_532.xys", md = "_635.xys",
sampleKey, sampleNames = NULL, pkgname, type = NULL, ...)
参数----------Arguments----------
参数：files
a vector of xys filenames
的XYS文件名的向量
参数：path
the path to the xys files
到XYS文件的路径
参数：ut
the file ending that designates untreated channel files
指定未处理通道文件的文件结束
参数：md
the file ending that designates methyl-depleted channel files
指定甲贫通道文件的文件结束
参数：sampleKey
a data frame with sample description information. One line per xys file.
与样品描述信息的数据框。一行每XYS文件。
参数：sampleNames
a vector of names to use for the samples. One line per xys file.
一个名字的向量使用的样品。一行每XYS文件。
参数：pkgname
the annotation package name
注释包名
参数：type
deprecated option
废弃的选项
参数：...
additional options passed on to read.xysfiles2
其他选项传递到read.xysfiles2
Details
详情----------Details----------
This function is a convenience wrapper to read.xysfiles2 to simplify reading in DNA methylation data from the Nimblegen McrBC/CHARM microarray platform. It makes guesses about the extensions used for the methyl-depleted (md) and untreated channels (ut).
此功能是一个方便的包装到read.xysfiles2中，以简化在阅读的NimbleGen McrBC /魅力芯片平台的DNA甲基化数据。它使甲基耗尽（MD）和未经处理的渠道（UT）扩展的猜测。
值----------Value----------
A TilingFeatureSet object.
TilingFeatureSet对象。
作者（S）----------Author(s)----------
Martin Aryee <aryee@jhu.edu>
参考文献----------References----------
参见----------See Also----------
methp, dmrFinder
methp，dmrFinder
举例----------Examples----------
# See normalizeBetweenSamples[看到normalizeBetweenSamples]
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注：
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发表于 2012-2-25 14:39:55
