segmentData(CGHcall)
segmentData()所属R语言包:CGHcall
Breakpoint detection for arrayCGH data.
断点检测arrayCGH数据。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
A wrapper function to run existing breakpoint detection algorithms on arrayCGH data. Currently only DNAcopy is implemented.
一个包装函数上运行现有的断点arrayCGH数据检测算法。目前只DNAcopy实施。
用法----------Usage----------
segmentData(input, method = "DNAcopy", ...)
参数----------Arguments----------
参数:input
Object of class cghRaw.
对象类cghRaw。
参数:method
The method to be used for breakpoint detection. Currently only 'DNAcopy' is supported, which will run the segment function.
该方法可用于断点检测。目前只有DNAcopy“支持,这将会运行segment功能。
参数:...
Arguments for segment.
segment论据。
Details
详情----------Details----------
See segment for details on the algorithm.
看到segment算法的细节。
值----------Value----------
This function returns a dataframe in the same format as the input with segmented arrayCGH data.
这个函数返回相同的格式为“与分段arrayCGH数据输入一个dataframe。
作者(S)----------Author(s)----------
Sjoerd Vosse & Mark van de Wiel
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
data(WiltingNorm)
## Not run: segmented.data <- segmentData(WiltingNorm, alpha=0.02)[#无法运行:segmented.data < - segmentData(WiltingNorm,α= 0.02)]
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