preprocess(CGHcall)
preprocess()所属R语言包:CGHcall
Preprocess arrayCGH data
预处理arrayCGH数据
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function preprocesses your aCGH data so it can be processed by other functions without errors.
此功能aCGH数据的预处理,因此它可以处理没有错误的其他职能。
用法----------Usage----------
preprocess(input, maxmiss = 30, nchrom = 23, ...)
参数----------Arguments----------
参数:input
Object of class cghRaw.
对象类cghRaw。
参数:maxmiss
Maximum percentage of missing values per row.
遗漏值每行的最大百分比。
参数:nchrom
Number of chromosomes.
染色体的数目。
参数:...
Arguments for impute.knn from the impute package.
impute.knn从归罪于包论据。
Details
详情----------Details----------
This function performs the following actions on arrayCGH data:
这个函数执行arrayCGH数据采取以下行动:
Filter out data with missing position information.
筛选出缺少位置信息的数据。
Remove data on chromosomes larger than nchrom.
删除比nchrom的染色体上的数据。
Remove rows with more than maxmiss percentage missing values.
删除行超过maxmiss缺少值的百分比。
Imputes missing values using the impute.knn function from the impute package.
责难失踪归罪于包impute.knn功能的值。
值----------Value----------
This function returns a dataframe in the same format as the input with missing values imputed.
这个函数返回相同的格式输入与遗漏值归咎于一个dataframe。
作者(S)----------Author(s)----------
Sjoerd Vosse & Mark van de Wiel
参考文献----------References----------
举例----------Examples----------
data(WiltingRaw)
preprocessed <- preprocess(WiltingRaw, nchrom = 22)
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注:
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注2:由于是机器人自动翻译,难免有不准确之处,使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解,可以帮助R语言的学习。
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