Convert a dataframe or textfile to an object of class cghRaw.
转换到dataframe一个类cghRaw的对象或文本文件。
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
This function converts a dataframe of appropriote format to an object of class cghRaw.
此功能转换appropriote格式dataframe一个类cghRaw的对象。
用法----------Usage----------
make_cghRaw(input)
参数----------Arguments----------
参数:input
Either a dataframe or character string containing a filename. See details for the format.
无论是dataframe或字符串包含一个文件名。格式的细节。
Details
详情----------Details----------
The input should be either a dataframe or a tabseparated textfile (textfiles must contain a header). The first four columns should contain the name, chromosome and the start and end position in bp for each array target respectively. The chromosome and position column must contain numbers only. Following these is a column with log2 ratios for each of your samples. If the input type is a textfile, missing values should be represented as 'NA' or an empty field.
输入应该是一个dataframe或tabseparated文本文件(文本文件必须包含一个头)。前四列应包含的名称,染色体和BP分别为每个阵列目标的开始和结束的位置。染色体和位置列必须只包含数字。以下这些是log2每个样品的比列。如果输入类型是文本文件,遗漏值应表示为“无”或空场。
值----------Value----------
This function returns an object of class cghRaw-class.
这个函数返回一个对象的类cghRaw-class。
作者(S)----------Author(s)----------
Sjoerd Vosse & Mark van de Wiel
举例----------Examples----------
data(Wilting)
## Convert to \code{\link{cghRaw}} object[#转换为\代码{\链接{cghRaw}的}对象]
cgh <- make_cghRaw(Wilting)