R语言 vegetarian包 turnover()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

turnover(vegetarian)
turnover()所属R语言包：vegetarian

                                        Turnover Rate per Sample
                                         每次采样的周转率

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

For numerous communities of equal weights, the numbers equivalent of the Shannon beta diversity and the number of samples (N) can be used to calculate the turnover rate per sample (Equation 25 from Jost 2007, Harrison et al. 1992).
对于许多社区相等的权重，可以使用的Shannon beta多样性和样品的数量（N）的数目相当于来计算每个样品的周转率（等式25从约斯特Harrison等人2007年，1992）。


用法----------Usage----------


turnover(abundances, abundances2 = NULL, q = 1, boot = FALSE, boot.arg = list(s.sizes = NULL, num.iter = 100))



参数----------Arguments----------

参数：abundances
Community data as a matrix where columns are individual species and rows are sites or a vector of different species within a site. Matrix and vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates).
数据列是一个矩阵，其中个别品种和行的社区网站或网站内的不同品种的一个向量。矩阵和向量元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。


参数：abundances2
Community data, a vector of different species within a site. Vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates). If abundances1 is given a matrix, then abundances2 defaults to NULL.
社区站点内的数据，不同物种的向量。 Vector元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。如果abundances1给出一个矩阵，然后abundances2默认设置为NULL。


参数：q
Order of the diversity measure. Defaults to the Shannon case where q = 1.
订购的多样性的措施。默认的Shannon情况下，q = 1时。


参数：boot
Logical indicating whether to use bootstrapping to estimate uncertainty.
逻辑指示是否使用自举到估计不确定性。


参数：boot.arg
(optional) List of arguments to pass bootstrapping function: list(s.sizes=number you specify, num.iter=number you specify)
（可选）的参数列表，通过自举功能：列表（s.sizes =您指定的号码，num.iter =您指定的号码）


值----------Value----------

<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>Turnover</td> <td> A scalar ranging from zero (no turnover between samples) to one (completely different samples).</td></tr> <tr valign="top"><td>StdErr</td> <td> (optional) Standard error of value estimated through bootstrapping.</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> Turnover</ TD> <td>一个标量从零（样本之间并无录得营业额）1（完全不同的样本） </ TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD> StdErr</ TD> <TD>（可选）通过自举的估计值的标准误差。</ TD> </ TR > </ TABLE>


（作者）----------Author(s)----------


Noah Charney, Sydne Record



参考文献----------References----------

Jost, L. 2007. Partitioning diversity into independent alpha and beta components. Ecology 88(10): 2427-2439.
Harrison, S., S. Ross, and J. Lawton. 1992. Beta diversity on geographic gradients in Britain. Journal of Animal Ecology 61: 151-158.

参见----------See Also----------

M.homog, Rel.homog, similarity, bootstrap
M.homog，Rel.homog，similarity，bootstrap


实例----------Examples----------


data(simesants)
turnover(simesants[,-1])
turnover(simesants[,-1],q=2,boot=TRUE)
turnover(simesants[,-1],q=2,boot=TRUE,boot.arg=list(num.iter=500))

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