R语言 vegetarian包 Rel.homog()函数中文帮助文档(中英文对照)

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Rel.homog(vegetarian)
Rel.homog()所属R语言包：vegetarian

                                        Relative Homogeneity
                                         相对同质化

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Provides a comparison between communities with unequal weights based on the numbers equivalent of the Shannon beta diversity (Jost 2007).  When community weights are not equal, the Shannon measures of diversity where q=1, are still valid and can be used to calculate a relative measure of homogeneity derived from MacArthur's homogeneity measure (Equation 22 from Jost 2007).
社区之间的不平等的权重数字相当于β多样性的香农（乔斯特2007）的基础上进行了比较。当社区的权重不相等，在香农的多样性的措施，其中q = 1时，仍然是有效的，并可以被用来计算同质性从麦克阿瑟的一致性测度（等式22从约斯特2007）衍生的相对度量。


用法----------Usage----------


Rel.homog(abundances, abundances2 = NULL, wts = FALSE, boot = FALSE, boot.arg = list(s.sizes = NULL, num.iter = 100))



参数----------Arguments----------

参数：abundances
Community data as a matrix where columns are individual species and rows are sites or a vector of different species within a site.  Matrix and vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates).
数据列是一个矩阵，其中个别品种和行的社区网站或网站内的不同品种的一个向量。矩阵和向量元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。


参数：abundances2
Community data, a vector of different species within a site.  Vector elements are abundance data (e.g. counts, percent cover estimates).  If abundances is given a matrix, then abundances2 defaults to NULL.
社区站点内的数据，不同物种的向量。 Vector元素的丰度数据（如计数，百分比盖的估计）。如果丰度矩阵，然后abundances2默认设置为NULL。


参数：wts
A vector of community weights whose length equals the number of communities being compared.  See details below for examples of when community weights might be treated as equal or unequal. Defaults to wts=FALSE where all communities are equally weighted.
社区的权重，其长度等于所比较的社区的数量的向量。查看详细资料社会的权重时，可能会被视为相等或者不相等的例子。默认WTS = FALSE，所有社区都同样加权。


参数：boot
Logical indicating whether to use bootstrapping to estimate uncertainty.
逻辑指示是否使用自举到估计不确定性。


参数：boot.arg
(optional) List of arguments to pass bootstrapping function: list(s.sizes=number you specify, num.iter=number you specify)
（可选）的参数列表，通过自举功能：列表（s.sizes =您指定的号码，num.iter =您指定的号码）


Details

详细信息----------Details----------

This measure assumes the Shannon case where the order q=1.
这项措施假定香农的情况下，阶数q = 1。


值----------Value----------

<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"><td>REL.HOMOG</td> <td> A scalar between zero (all communities distinct) and one (all communities identical).</td></tr> <tr valign="top"><td>StdErr</td> <td> (optional) Standard error of value estimated through bootstrapping.</td></tr> </table>
<table summary="R valueblock"> <tr valign="top"> <TD> REL.HOMOG </ TD> <TD>之间的零（所有社区不同）和一个标量（所有社区相同）。 / TD> </ TR> <tr valign="top"> <TD>StdErr</ TD> <TD>（可选）标准误差的估计值，通过自举。</ TD> </ TR> < / TABLE>


（作者）----------Author(s)----------


Noah Charney, Sydne Record



参考文献----------References----------

<h3>See Also</h3>   <code>M.homog</code>, <code>similarity</code>, <code>turnover</code>.

实例----------Examples----------


data(simesants)
Rel.homog(simesants[1:2,-1])
hemlock<-subset(simesants,Habitat=="Hemlock")[,-1]
hardwood<-subset(simesants,Habitat=="Hardwood")[,-1]
Rel.homog(abundances=hemlock,abundances2=hardwood)
Rel.homog(simesants[1:2,-1], boot=TRUE)

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