syntab(vegdata)
syntab()所属R语言包:vegdata
Frequency table
频率表
译者:生物统计家园网 机器人LoveR
描述----------Description----------
Make relative or absolute frequency tables.
相对或绝对频率表。
用法----------Usage----------
syntab(veg, clust, type = c('rel','abs','mean.cover'), fullnames=FALSE, limit=0, mupa=NULL, alpha=0.05, minstat=0, dec=0, refl, ...)
参数----------Arguments----------
参数:veg
Vegetation dataframe
植被数据框
参数:clust
Vector with cluster information with length equal to number of rows of veg
向量的聚类的信息长度的蔬菜的行数等于
参数:type
Relative or absolute frequency, mean species response values or strength of association (see function multipatt in package indicspecis).
相对或绝对频率,是指物种的响应值或强度协会(见包indicspecis功能multipatt)。
参数:fullnames
Replace rownames (LETTERCODES) with full scientific names.
有充分的科学名称,更换行名(LETTERCODES)。
参数:limit
Minimum value to display.
最低值显示。
参数:mupa
Either logical for (not) using multipatt from package indispecies to detect significance of cluster association strength or supply output from previous use of multipatt.
无论是逻辑(不),使用multipatt从包indispecies到检测意义的的聚类关联强度或从以前的multipatt使用的电源输出。
参数:alpha
Significance threshold.
显着性阈值。
参数:minstat
Minimal indicator value
最小的指标值
参数:dec
Number of decimals in result.
结果中的小数位数的号码。
参数:refl
Name of Turboveg taxonomic reference list to use for fullnames.
名称Turboveg分类参考目录使用fullnames。
参数:...
additional arguments
额外的参数
(作者)----------Author(s)----------
Florian Jansen <a href="mailto:jansen@uni-greifswald.de">jansen@uni-greifswald.de</a>
参见----------See Also----------
package indicspecies from M. Cac\'eres with function multipatt for indicator species analysis along multiple cluster combinations
与的包indicspecies CAC \M. ERES指示种分析沿的功能multipatt为多个聚类组合
实例----------Examples----------
data(elbaue)
clust <- vector('integer', nrow(elbaue.env))
clust[elbaue.env$MGL < -50 & elbaue.env$SDGL < 50] <- 1
clust[elbaue.env$MGL < -50 & elbaue.env$SDGL >= 50] <- 2
clust[elbaue.env$MGL >= -50 & elbaue.env$SDGL >= 50] <- 3
clust[elbaue.env$MGL >= -50 & elbaue.env$SDGL < 50] <- 4
# syntab(elbaue, clust, limit=30)[syntab(elbaue,clust,上限= 30)]
levels(clust) <- c('dry.ld','dry.hd', 'wet.hd','wet.ld')
## Not run: [#不运行:]
syntab(elbaue, clust, limit=30, mupa=TRUE)
## End(Not run)[#(不执行)]
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