R语言 vegclust包 hcr()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

hcr(vegclust)
hcr()所属R语言包：vegclust

                                         Heterogeneity-constrained random resampling (HCR)
                                         异质性约束的随机重采样（HCR）

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Returns a set of indices of the original data set that maximizes the mean and minimizes the variance of the distances between pairs of plot records.
返回最大化的均值和对图记录之间的距离的方差最小化的原始数据集的一组的索引。


用法----------Usage----------


hcr(d, nout, nsampl=1000)



参数----------Arguments----------

参数：d
An object of class dist containing the distance values between pairs of sites (plot records).
类的一个对象dist含有对网站（图记录）之间的距离值。


参数：nout
The number of sites (plot records) to be chosen among those available in d.
的站点数（图记录）间那些在d的选择。


参数：nsampl
The number of resampling trials to be compared.
重采样试验的数目进行比较。


Details

详细信息----------Details----------

Many subsets of the input data are selected randomly. These subsets are sorted by decreasing mean dissimilarity between pairs of plot records, and then sorted again by increasing variance of these dissimilarities. Ranks from both sortings are summed for each subset, and the subset with the lowest summed rank is considered as the most representative.
许多子集，所输入的数据被随机地选择。这些子集进行排序，通过减少对图记录之间的平均差异性排序，然后再通过增加这些差异的方差。对于每个子集的行列从两个sortings的相加，并与最低总结排名的子集被认为是最有代表性的。


值----------Value----------

Returns a vector containing the indices of the selected sites (plot records) to be used for sub-setting the original table.
返回一个向量，包含所选择的网站（图记录）用于设置原始表的索引。


（作者）----------Author(s)----------



Miquel De C谩ceres, Forest Science Center of Catalonia




参考文献----------References----------

Lengyel, A., Chytry, M., Tichy, L. (2011) Heterogeneity-constrained random resampling of phytosociological databases. Journal of Vegetation Science 22: 175-183.

实例----------Examples----------



#Loads data (38 columns and 33 species)[数据加载（38列和33种）]
data(wetland)
dim(wetland)

# Constructs the chord distance matrix[构造的弦距矩阵]
# This equals the chord transformation (see also 'normalize' option in \code{\link{decostand}} from the vegan package)[这等于和弦转换（参见标准化选项\ {\的链接{decostand}}从素食包的代码）]
wetland.chord =dist(as.data.frame(sweep(as.matrix(wetland), 1, sqrt(rowSums(as.matrix(wetland)^2)), "/")))

#Performs HCR resampling. Returns indices of objects[执行HCR重采样。返回的对象的索引]
sel = hcr(wetland.chord, nout=20, nsampl=1000)

#Prints the names of the plot records[打印的图记录的名称]
print(row.names(wetland)[sel])

#Subset the original distance matrix[子集的原距离矩阵]
sel.chord = as.dist(as.matrix(wetland.chord)[sel,sel])

转载请注明:出自 生物统计家园网(http://www.biostatistic.net)。


注：
注1：为了方便大家学习，本文档为生物统计家园网机器人LoveR翻译而成，仅供个人R语言学习参考使用，生物统计家园保留版权。
注2：由于是机器人自动翻译，难免有不准确之处，使用时仔细对照中、英文内容进行反复理解，可以帮助R语言的学习。
注3：如遇到不准确之处，请在本贴的后面进行回帖，我们会逐渐进行修订。