R语言 vegan包 wascores()函数中文帮助文档(中英文对照)

loveR

wascores(vegan)
wascores()所属R语言包：vegan

                                         Weighted Averages Scores for Species
                                         加权平均分数物种

                                         译者：生物统计家园网 机器人LoveR

描述----------Description----------

Computes Weighted Averages scores of species for ordination configuration or for environmental variables.
计算物种的协调配置或环境变量的加权平均分数。


用法----------Usage----------


wascores(x, w, expand=FALSE)
eigengrad(x, w)



参数----------Arguments----------

参数：x
Environmental variables or ordination scores.
环境变量或协调的分数。


参数：w
Weights: species abundances.
重量：物种丰度。


参数：expand
Expand weighted averages so that they have the same weighted variance as the corresponding environmental variables.   
展开加权平均值，使它们具有相同的加权作为相应的环境变量的方差。


Details

详细信息----------Details----------

Function wascores computes weighted averages. Weighted averages "shrink": they cannot be more extreme than values used for calculating the averages. With expand = TRUE, the function "dehsrinks" the weighted averages by making their biased weighted variance equal to the biased weighted variance of the corresponding environmental variable.  Function eigengrad returns the inverses of squared expansion factors or the attribute shrinkage of the wascores result for each environmental gradient.  This is equal to the constrained eigenvalue of cca when only this one gradient was used as a constraint, and describes the strength of the gradient.
函数wascores计算加权平均值。加权平均值“缩水”：他们不能被用于计算平均值的值更极端的比。用expand = TRUE，功能的dehsrinks“，使他们的偏见的加权方差等于偏颇相应的环境变量的加权方差的加权平均值。功能eigengrad返回的逆平方扩张的因素或属性shrinkage的wascores每个环境梯度的结果。这是等于cca约束特征值只有这一个梯度作为一个约束条件，并介绍了强度的梯度。


值----------Value----------

Function wascores returns a matrix where species define rows and ordination axes or environmental variables define columns. If expand = TRUE, attribute shrinkage has the inverses of squared expansion factors or cca eigenvalues for the variable.  Function eigengrad returns only the shrinkage attribute.
功能wascores返回一个矩阵，其中的物种定义行和协调轴或环境变量的定义列。如果expand = TRUE属性shrinkage的逆平方扩张的因素或cca特征值的变量。函数eigengrad只返回shrinkage属性。


（作者）----------Author(s)----------


Jari Oksanen



参见----------See Also----------

monoMDS, cca.
monoMDS，cca。


实例----------Examples----------


data(varespec)
data(varechem)
vare.dist <- vegdist(wisconsin(varespec))
vare.mds <- monoMDS(vare.dist)
vare.points <- postMDS(vare.mds$points, vare.dist)
vare.wa <- wascores(vare.points, varespec)
plot(scores(vare.points), pch="+", asp=1)
text(vare.wa, rownames(vare.wa), cex=0.8, col="blue")
## Omit rare species (frequency &lt;= 4)[＃省略稀有物种（频率<= 4）]
freq <- apply(varespec>0, 2, sum)
plot(scores(vare.points), pch="+", asp=1)
text(vare.wa[freq > 4,], rownames(vare.wa)[freq > 4],cex=0.8,col="blue")
## Works for environmental variables, too.[＃工程的环境变量了。]
wascores(varechem, varespec)
## And the strengths of these variables are:[＃和优势，这些变量是：]
eigengrad(varechem, varespec)

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